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[求助]
微生物高通量測序 已有2人參與
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親們，高通量測序里都需要統(tǒng)一測序深度嗎？公司統(tǒng)一測序度得標(biāo)準(zhǔn)為我7個樣品里reads最小的那個樣品10029，而我其他樣品里最多的達(dá)到了105009，是最小的那個的10倍以上，這樣計算的多樣性結(jié)果可靠嗎？還有我那個稀釋曲線在統(tǒng)一測序深度的那個點能反映樣本微生物的多樣性嗎  1.png 2.png |
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4樓2015-11-20 19:42:34
2樓2015-11-20 18:47:12
great07225388
新蟲 (著名寫手)
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- 專業(yè): 生物信息學(xué)
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
音樂之聲0921: 金幣+8, ★★★很有幫助 2015-11-20 19:42:00
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
音樂之聲0921: 金幣+8, ★★★很有幫助 2015-11-20 19:42:00
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這個涉及到數(shù)據(jù)的抽平的問題，數(shù)據(jù)抽不抽平不影響微生物群落結(jié)構(gòu)，但是對樣品群落豐富度評估的幾個參數(shù)有影響。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
3樓2015-11-20 19:26:38
5樓2015-11-20 19:46:02
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