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woshisheia金蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
Autodock結(jié)果分析求助 已有1人參與
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| dock的結(jié)果里面，為什么蛋白里面本來(lái)沒(méi)有H原子的N原子上出現(xiàn)了H原子，而且還有一個(gè)N原子上的H原子和小分子上的O原子之間形成了氫鍵，這個(gè)結(jié)果合理嗎？在描述結(jié)果的時(shí)候，是否可以這樣描述：小分子的O原子和蛋白上的N原子之間形成了氫鍵？ |
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2樓2015-11-25 16:11:20
waltq
木蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
- 應(yīng)助: 3 (幼兒園)
- 金幣: 1220.9
- 散金: 2688
- 紅花: 1
- 帖子: 756
- 在線: 607小時(shí)
- 蟲(chóng)號(hào): 47915
- 注冊(cè): 2004-06-12
- 性別: GG
- 專(zhuān)業(yè): 發(fā)育生物學(xué)與生殖生物學(xué)
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樓主，我也在學(xué)習(xí)分子對(duì)接，好不容易走到autodock這一步，但是dlg文件又打不開(kāi)，出現(xiàn)下面的問(wèn)題，看了半天不知所云。望樓主指點(diǎn)一下。另外，我的系統(tǒng)是32位win7。 IDLE 1.2.2 ==== No Subprocess ==== >>> exception in _buildInputLig ERROR ********************************************* Traceback (most recent call last): File "C:\Program Files\MGLTools-1.5.6\lib\site-packages\ViewerFramework\VF.py", line 898, in tryto result = command( *args, **kw ) File "C:\Program Files\MGLTools-1.5.6\lib\site-packages\AutoDockTools\autoanalyzeCommands.py", line 3852, in doit d.readDlg(dlgFile) File "C:\Program Files\MGLTools-1.5.6\lib\site-packages\AutoDockTools\Docking.py", line 105, in readDlg self.ch = ConformationHandler(self.ligMol, AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol' Exception in Tkinter callback Traceback (most recent call last): File "C:\Program Files\MGLTools-1.5.6\lib\lib-tk\Tkinter.py", line 1403, in __call__ return self.func(*args) File "C:\Program Files\MGLTools-1.5.6\lib\site-packages\AutoDockTools\autoanalyzeCommands.py", line 5482, in guiCallback if hasattr(d.ligMol, 'vina_energy'): AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol' |
3樓2016-03-04 17:12:00
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