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a344902006新蟲 (初入文壇)
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[求助]
GUASSIAN中遇到的一點(diǎn)語法問題。 已有1人參與
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輸入中每個(gè)原子都有(PDBNAME=X,RESNAME=X,RESNUM=X), 然后運(yùn)行就有語法錯(cuò)誤,把它們刪掉后,就可以正常運(yùn)行,為什么呢? |
八龍尊者 |
木蟲 (著名寫手)
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PDB文件參數(shù) 有一些附加項(xiàng)可以與核參數(shù)和/或片段一起定義。這些項(xiàng)與PDB文件一起使用,用于保留其中包含的殘基以及其它結(jié)構(gòu)信息,這樣用戶無需再作定義。但是,你可能會(huì)在GaussView用源自PDB文件的結(jié)構(gòu)創(chuàng)建的Gaussian 09輸入文件中看到它們。 RESNum指定原子所位于的殘基。該值的格式為n[X[Y]],其中n是一個(gè)整數(shù)(未必為正), X是一個(gè)可選的單個(gè)字符插入代碼,是可選的鏈字母。如果定義了鏈但沒有插入代碼, 那么X可以是下劃線:ResNum=-17_C用于鏈C上編號(hào)為-17的殘基。 RESName指定三個(gè)字符的殘基名。 PDBName如果不是元素名的話,指定賦值給原子的名稱。 摘自高斯手冊(cè)。至于你說的情況,沒有輸入文件,不好判斷。 |
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