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tonyde新蟲 (初入文壇)
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[求助]
構(gòu)建RNAi植物表達(dá)載體,連接多次失敗,向各位前輩求助! 已有2人參與
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構(gòu)建RNAi植物表達(dá)載體,連接多次失敗,我把遇到的情況列了一下,希望有經(jīng)驗前輩們幫忙分析一下原因! 1.目的片段(一個基因的正向片段加內(nèi)含子加反向片段)之前已經(jīng)連到中間載體上了,目的片段大小為1200bp,植物表達(dá)載體11600bp 2.酶切位點(diǎn)用的是Apa I和BamH I 3.連接體系10uL和20uL都試過,載體和片段比例從1:6到1:10也都試過,T4連接酶是NEB的 4.連了好幾次,一開始板上不長菌,后來長菌了,菌液PCR也有帶,提質(zhì)粒大小竟然是4000bp左右(真是神奇),用Apa I和BamH I切后有兩條帶,一條900bp左右,一條1100-1200bp左右(更神奇了 )。再后來還有一種情況,板上長菌,提出質(zhì)粒后大小12000bp左右(大小是對的),但是提質(zhì)粒,質(zhì)粒PCR全都沒有帶。5.已發(fā)現(xiàn)的問題: 表達(dá)載體用Apa I單酶切的時候會切下來一條2000bp左右的帶(但是載體圖譜里只有一個Apa I酶切位點(diǎn)),這個載體是向其他實驗室要的,他們之前做過跟我一樣的實驗(酶切位點(diǎn)都一樣,只有基因不一樣),但是他們的論文里沒說這個載體有2個Apa I位點(diǎn)啊! 各位大神們,提出質(zhì)粒4000bp是怎么回事?連的不對是不是我的表達(dá)載體有問題啊? |
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