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zhoutianhe

銅蟲 (小有名氣)

應(yīng)助: 1 (幼兒園)
金幣: 182.5
帖子: 112
在線: 43.2小時
蟲號: 2088204
注冊: 2012-10-26
性別: GG
專業(yè): 動物系統(tǒng)及分類學(xué)

[求助] 關(guān)于種群歷史動態(tài)（demography）已有1人參與

大家好！請問計算種群歷史動態(tài)時是用所有的序列還是只用單倍型序列呢？

回復(fù)此樓

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1樓 2015-12-03 09:34:58

已閱回復(fù)此樓關(guān)注TA 給TA發(fā)消息送TA紅花 TA的回帖

jiaobingke

鐵蟲 (初入文壇)

應(yīng)助: 0 (幼兒園)
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蟲號: 3202393
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性別: GG
專業(yè): 生物信息學(xué)

【答案】應(yīng)助回帖

PSMC，MSMC，smc++類的軟件只能接收二倍體數(shù)據(jù)，不能接收單倍體數(shù)據(jù)。stairway plot軟件的文章中以人類重測序數(shù)據(jù)為例，也是接收二倍體數(shù)據(jù)。但是計算頻譜應(yīng)該可以用單倍體的數(shù)據(jù)。其他做種群動態(tài)史的軟件因為基本原理可能不同，能否接收單倍體數(shù)據(jù)需要看軟件的說明書。

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回復(fù)此樓

知過能改，善莫大焉

2樓2020-06-24 09:21:50

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