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[求助]
lammps新手超簡(jiǎn)單程序疑問 已有3人參與
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寫了一個(gè)簡(jiǎn)單的Lammps程序，但是問題多多，實(shí)在無法解答，求助。 我上傳了附件，求大俠下載試試！ 文件在附件中，執(zhí)行操作如下： E:\lammps>lmp_win_no-mpi -in example.input LAMMPS (12 Apr 2013) Reading data file ... orthogonal box = (-2 -2 -2) to (2 2 2) 1 by 1 by 1 MPI processor grid ERROR: Unknown identifier in data file: 1 12.01 (../read_data.cpp:343) 提示在Masses的第一行時(shí)錯(cuò)了，好奇怪，求大俠解疑。。。新手。 我在data文件中寫了Header了，還是錯(cuò)誤。。。。哪位下載下來直接運(yùn)行看看我哪里錯(cuò)了 Lammps程序?yàn)椋?br /> variable vz index 10 20 log log_${vz}.txt units metal dimension 3 boundary f p s atom_style atomic read_data example.data pair_style tersoff pair_coeff * * SiCGe.tersoff C C C group a id == 1 3 5 group 1 id == 2 4 6 group a1 union a 1 neighbor 2.0 bin neigh_modify delay 0 minimize 1.0e-6 1.0e-6 1000 1000 fix 1 all nve thermo 100 compute 1 all temp compute 2 all ke/atom compute 3 all pe/atom variable et atom c_2[]+c_3[] fix 2 all ave/time 1 1 10 c_1 file temp_${vz}.dat dump 1 all xyz 100 config_${vz}.dat dump 2 all custom 100 etotal_${vz}.dat v_et velocity all create 400.0 273237 units box run 1000 clear next vz jump example.input example.dat文件為： LAMMPS data file 6 atoms 3 atoms types -2 2 xlo xhi -2 2 ylo yhi -2 2 zlo zhi Masses 1 12.01 2 12.01 3 12.01 Atoms 1 1 1.000000 0.000000 0.000000 2 2 0.500000 0.866025 0.000000 3 3 -0.500000 0.866025 0.000000 4 3 -1.000000 0.000000 0.000000 5 2 -0.500000 -0.866025 0.000000 6 1 0.500000 -0.866025 0.000000 以上data文件我寫了Header了。 |
回復(fù)此樓» 本帖附件資源列表
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- 附件 2 : example.data
2015-12-03 22:04:00, 686 bytes
2015-12-03 22:04:05, 342 bytes
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2樓2015-12-04 19:52:20
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【答案】應(yīng)助回帖
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好像不應(yīng)該是atoms types ,atoms后面不要加復(fù)數(shù) 。這是我寫的例子，你比較看看 http://pan.baidu.com/s/1mgVmumc |
3樓2015-12-07 11:14:23
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【答案】應(yīng)助回帖
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ERROR: Unknown identifier in data file: 1 12.01 (../read_data.cpp:343) 提示在Masses的第一行時(shí)錯(cuò)了，好奇怪，求大俠解疑。。。新手。 lammps明顯提示mass這里出錯(cuò)了，檢查下格式... 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
4樓2015-12-07 12:35:08
tang_wei
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5樓2015-12-07 16:15:26
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6樓2015-12-07 23:27:36
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