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sheep916628新蟲 (小有名氣)
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[求助]
關(guān)于高斯計算配合物結(jié)構(gòu)和能量中出現(xiàn)的問題(配位鍵變成了實鍵) 已有2人參與
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打算用高斯09算一個含銅配合物的結(jié)構(gòu)和能量，圖1是計算好的配合物的構(gòu)型，中間肉色的是Cu原子，圖2圖3是用到的計算參數(shù)，原始結(jié)構(gòu)圖如圖4所示，發(fā)現(xiàn)原先配合物中的配位鍵變成了實鍵，還有發(fā)生斷裂的情況，請問是不是我原始結(jié)構(gòu)圖搭錯了還是我計算參數(shù)出現(xiàn)了問題？謝謝各位，求幫助啊~~~ 3.png 4.jpg 2.png |
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 八龍尊者 | 計算化學(xué) |
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sheep916628: 金幣+5, ★有幫助, 謝謝說明 2015-12-07 14:57:30
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sheep916628: 金幣+5, ★有幫助, 謝謝說明 2015-12-07 14:57:30
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沒有問題，高斯默認：當(dāng)鍵長較短時畫做實鍵，高于一個設(shè)定值（常見中心離子配合物一般2埃多點）時，不顯示鍵。 樓主可以回想一下高斯的輸入文件，只是定義了各個原子初始位置，有沒有鍵都一樣，只是高斯把原子之間力大的畫了個鍵方便你理解罷了。 順帶一說，B3LYP算配合物鍵長會偏長較多。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
6樓2015-12-05 12:26:04
sheep916628
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2樓2015-12-04 10:48:42
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3樓2015-12-04 12:20:00
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4樓2015-12-04 14:53:58
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5樓2015-12-04 16:00:31
【答案】應(yīng)助回帖
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sheep916628: 金幣+5, ★有幫助, 這個結(jié)構(gòu)是肯定存在的，搭好模型后顯示的也是電中性 2015-12-07 15:02:11
liliangfang: 金幣+1, 謝謝交流 2015-12-12 13:44:28
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
sheep916628: 金幣+5, ★有幫助, 這個結(jié)構(gòu)是肯定存在的，搭好模型后顯示的也是電中性 2015-12-07 15:02:11
liliangfang: 金幣+1, 謝謝交流 2015-12-12 13:44:28
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首先，請確認一下是不是Doublet，還有到底帶不帶電 其次，請至少使用6-31G(d),里面有Cu，不知道是不是應(yīng)該用ECP 建議Calculate Force 取 Once，結(jié)構(gòu)能夠比較快的收斂。 最后，請務(wù)必確認結(jié)構(gòu)的合理性合法性，如果在算一個沒有意義的結(jié)構(gòu)，結(jié)果是沒有意義的。 |
7樓2015-12-07 10:20:57
sheep916628
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8樓2015-12-07 15:02:51
9樓2015-12-07 15:19:42
【答案】應(yīng)助回帖
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liliangfang: 金幣+1, 謝謝交流 2015-12-12 13:44:34
liliangfang: 金幣+1, 謝謝交流 2015-12-12 13:44:34
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我建議先用從頭算，ccsd mp4，上大基組先試一下同中心離子，同配位原子的簡單配合物，比如N就替換成NH3。鍵長心里大概有數(shù)（當(dāng)然，考慮大基團對它的影響）。然后像TPSS，PW91，P86這類 文獻常見的GGA都先上小基組試試，各個參數(shù)調(diào)一調(diào)再上大基組。最好別用Hybrid GGA，混合HF之后挺坑。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
10樓2015-12-07 15:23:44
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