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luqing6879木蟲 (著名寫手)
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如果通過笛卡爾坐標(biāo)確定分子點(diǎn)群？ 已有2人參與
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現(xiàn)在計(jì)算的是一個(gè)分子通式為AB4型的分子。在笛卡爾坐標(biāo)C1點(diǎn)群下優(yōu)化計(jì)算頻率可以看到有簡并的頻率存在。通過可視化軟件可以看到分子近似于Td點(diǎn)群。所以認(rèn)為分子只可能采取Td，D2d或C3v中的一種。 然而當(dāng)采用z矩陣坐標(biāo)重新優(yōu)化計(jì)算頻率時(shí)，不論Td或D2d點(diǎn)群都給出兩個(gè)虛頻。 請(qǐng)問該如何確定這個(gè)分子的點(diǎn)群呢？ 謝謝。 |
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2樓2015-12-08 08:29:43
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4樓2015-12-08 11:21:02
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更新一下，現(xiàn)在用另一個(gè)軟件chemcraft“識(shí)別”點(diǎn)群并生成相應(yīng)的z矩陣坐標(biāo)（這里是生成D2d點(diǎn)群的z矩陣）。在C1對(duì)稱性下得到全實(shí)的頻率，優(yōu)化后的坐標(biāo)參數(shù)是 R12= 2.09053704 ANG A213= 99.36784889 DEGREE A314= 114.73317695 DEGREE D2314= 122.88817885 DEGREE A215= 114.73316130 DEGREE D3215= 122.88810149 DEGREE geometry={ La1 F1,la1,R12 F2,la1,R12,f1,A213 F3,la1,R12,f2,A314,f1,D2314 F4,la1,R12,f1,A215,f2,D3215 } 但是當(dāng)我試圖使A314=A215, 并且使D2314=D3215時(shí)，程序只能將其識(shí)別為C2點(diǎn)群。 怎么改才能變成D2d點(diǎn)群呢？ 謝謝。 |
5樓2015-12-08 13:30:24
beefly
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7樓2015-12-09 05:20:20
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8樓2015-12-09 09:44:10
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