 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 4 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 928 | 回復(fù): 3 | |||
新手已上路木蟲 (職業(yè)作家)
|
[交流]
哈佛研究推翻長(zhǎng)期持有的生物學(xué)假設(shè) 已有3人參與
|
|
最近，哈佛大學(xué)醫(yī)學(xué)院（HMS）的研究人員，開發(fā)出一種數(shù)學(xué)工具，可以準(zhǔn)確地描述發(fā)育早期階段青蛙胚胎中的蛋白質(zhì)數(shù)量。該工具還可以確定，哪些蛋白質(zhì)是受精時(shí)出現(xiàn)的，哪些蛋白質(zhì)是后來(lái)由胚胎本身產(chǎn)生的。這些研究結(jié)果最近發(fā)表在《Developmental Cell》。延伸閱讀：Nature子刊解決長(zhǎng)期發(fā)育學(xué)謎題。 本文第一作者、HMS系統(tǒng)生物學(xué)講師Leonid Peshkin指出：“我們首次能夠解密胚胎的所謂的蛋白質(zhì)經(jīng)濟(jì)（蛋白質(zhì)組）�！� 更重要的是，研究人員獲得了一個(gè)“與許多科學(xué)家長(zhǎng)期持有的假設(shè)相反”的結(jié)果，即，信使RNA在細(xì)胞中的表達(dá)水平，可以用作蛋白質(zhì)水平的一個(gè)衡量。起初，這個(gè)概念似乎是合理的。如果RNA產(chǎn)生蛋白質(zhì)，那么細(xì)胞中高水平的RNA水平，則表明高水平的蛋白質(zhì)，反之亦然。然而Peshkin和他的團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)，這個(gè)假設(shè)往往是錯(cuò)誤的。 當(dāng)Peshkin考慮發(fā)育胚胎中的蛋白質(zhì)分配問(wèn)題時(shí)，他將此比作一場(chǎng)宴會(huì)。如果你邀請(qǐng)了一大群人，你不想提前幾天準(zhǔn)備好一切，因?yàn)闆](méi)有人喜歡吃一個(gè)星期的沙拉。你也不想當(dāng)人們出現(xiàn)時(shí)才開始準(zhǔn)備食物，特別是，烤肉需要腌七個(gè)小時(shí)。這兩個(gè)極端都會(huì)浪費(fèi)精力。很顯然，正確的做法是，事先準(zhǔn)備與現(xiàn)場(chǎng)需要做的工作，實(shí)現(xiàn)很好的平衡。訣竅是決定這種平衡。 對(duì)于蛋白質(zhì)分配也是如此。一些蛋白質(zhì)在受精的那一刻存入胚胎中，而另一些則是在胚胎生長(zhǎng)時(shí)根據(jù)需要生產(chǎn)的。對(duì)于生物學(xué)家來(lái)說(shuō)，了解這個(gè)過(guò)程的動(dòng)力學(xué)，是理解基本發(fā)育生物學(xué)的關(guān)鍵。 傳統(tǒng)上，研究人員使用RNA表達(dá)水平來(lái)評(píng)估蛋白質(zhì)水平。Peshkin決定檢測(cè)這種方法。他和他的同事們確定了青蛙胚胎中的10000個(gè)基因，并用質(zhì)譜儀測(cè)量了整個(gè)發(fā)育過(guò)程中它們后來(lái)編碼的所有蛋白的水平。然后，他們將這些測(cè)量值與在同一時(shí)期的RNA表達(dá)水平進(jìn)行了比較。 然后Peshkin重復(fù)這個(gè)實(shí)驗(yàn)，這一次只測(cè)量受精那一刻的蛋白質(zhì)水平，不包括整個(gè)發(fā)育過(guò)程中的蛋白質(zhì)數(shù)量。他將這個(gè)數(shù)據(jù)，包括RNA表達(dá)水平，輸入一個(gè)預(yù)測(cè)性算法。該算法對(duì)來(lái)自這兩個(gè)數(shù)據(jù)集的信息進(jìn)行運(yùn)算，然后確定早期發(fā)育每個(gè)階段的蛋白質(zhì)數(shù)量。 Peshkin發(fā)現(xiàn)，如果僅僅使用RNA表達(dá)作為蛋白質(zhì)數(shù)量的衡量——研究人員長(zhǎng)期持有的約定，大部分時(shí)間，研究結(jié)果將是不準(zhǔn)確的，尤其是在蛋白質(zhì)快速產(chǎn)生和快速降解的情況下。另一方面，他的預(yù)測(cè)算法，在大部分時(shí)間是準(zhǔn)確的。 令人吃驚的是，他和他的同事們發(fā)現(xiàn)，許多蛋白質(zhì)——對(duì)于以后的器官功能至關(guān)重要，被儲(chǔ)存在卵母細(xì)胞中（即使它受精之前）。這個(gè)原因是意想不到的，因?yàn)樵S多這些蛋白質(zhì)是組織特異性的，不僅在受精卵中沒(méi)有用途，而且如果它們使用得太早，可能對(duì)胚胎是有毒的。 Peshkin將調(diào)查的下一個(gè)問(wèn)題是，卵子如何設(shè)法抑制這些蛋白質(zhì)。本文簡(jiǎn)要地提及到了翻譯后蛋白質(zhì)修飾（例如，磷酸化）在胚胎發(fā)育中的作用和動(dòng)力學(xué)。但這些觀察結(jié)果只是冰山一角。 他沉思，這通常是生物醫(yī)學(xué)研究的案例。新發(fā)現(xiàn)往往導(dǎo)致進(jìn)一步的問(wèn)題。他說(shuō)：“在實(shí)驗(yàn)室里這是一個(gè)笑話。通常，標(biāo)題是，‘前所未有的大型數(shù)據(jù)集，揭示了生物學(xué)中我們不了解的新深度’。” 現(xiàn)在，對(duì)于研究感興趣的特定蛋白的科學(xué)家來(lái)說(shuō)，該工具是可以在線獲取的。 |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
309求調(diào)劑
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
一志愿南航 335分 | 0856 | GPA 4.07 | 有科研經(jīng)歷
已經(jīng)有8人回復(fù)
-
求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
求化學(xué)調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
085600，材料與化工321分求調(diào)劑
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
0703 化學(xué) 求調(diào)劑，一志愿山東大學(xué) 342 分
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
一志愿南開大學(xué)0710生物學(xué)359求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
085600，專業(yè)課化工原理，320分求調(diào)劑
已經(jīng)有4人回復(fù)
-
材料與化工272求調(diào)劑
已經(jīng)有16人回復(fù)
-
290求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
羅振宇
新蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 0 (幼兒園)
- 金幣: 588.7
- 帖子: 150
- 在線: 18小時(shí)
- 蟲號(hào): 4273207
- 注冊(cè): 2015-12-07
- 專業(yè): 環(huán)境微生物學(xué)
2樓2015-12-09 09:50:59
fuyuandj86
版主 (著名寫手)
己所不欲，勿施于人
- BioEPI: 1
- 應(yīng)助: 397 (碩士)
- 貴賓: 0.015
- 金幣: 7578.5
- 散金: 495
- 紅花: 60
- 沙發(fā): 2
- 帖子: 1313
- 在線: 1387.3小時(shí)
- 蟲號(hào): 544795
- 注冊(cè): 2008-04-13
- 性別: GG
- 專業(yè): 生物化學(xué)
- 管轄: 生物科學(xué)
3樓2015-12-09 23:49:57
xp198766
鐵桿木蟲 (著名寫手)
小木蟲職業(yè)打醬油滴~~！
- 應(yīng)助: 5 (幼兒園)
- 金幣: 6525.1
- 散金: 262
- 紅花: 25
- 帖子: 2193
- 在線: 554小時(shí)
- 蟲號(hào): 1046859
- 注冊(cè): 2010-06-24
- 性別: GG
- 專業(yè): 環(huán)境微生物學(xué)
★
小木蟲: 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
小木蟲: 金幣+0.5, 給個(gè)紅包，謝謝回帖
|
現(xiàn)在蛋白質(zhì)組這么火，可想而知RNA與蛋白的相關(guān)性并不是那么高了。 蛋白質(zhì)的問(wèn)題在于，蛋白質(zhì)不好通過(guò)像核酸的那種PCR放大，如果量少了就不容易檢測(cè)到，同時(shí)也存在定性準(zhǔn)確性的問(wèn)題，也許隨著數(shù)據(jù)庫(kù)的不斷積累可以解決，但是蛋白質(zhì)信號(hào)放大，或者儀器靈敏度增加，還需要一個(gè)較長(zhǎng)的過(guò)程。 能在胚胎中檢測(cè)到10000個(gè)基因，應(yīng)該是核酸水平吧，不知道他們能檢測(cè)到多少個(gè)蛋白？ |
4樓2015-12-10 09:14:42
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 新手已上路 的主題更新
| 4 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 317分 一志愿南理工材料工程 本科湖工大 求調(diào)劑 +10 | 芋泥小鈴鐺 2026-03-28 | 10/500 |
|
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 一志愿南昌大學(xué)324求調(diào)劑 +5 | hanamiko 2026-03-29 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿雙一流機(jī)械285分求調(diào)劑 +4 | 幸運(yùn)的三木 2026-03-29 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑一志愿武漢理工大學(xué)材料工程（085601） +7 | WW.' 2026-03-23 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 356求調(diào)劑 +4 | gysy?s?a 2026-03-28 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 298求調(diào)劑 +4 | 種圣賜 2026-03-28 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 305求調(diào)劑 +8 | RuiFairyrui 2026-03-28 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 299求調(diào)劑 +7 | 嗯嗯嗯嗯2 2026-03-27 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 070300求調(diào)劑306分 +4 | 26要上岸 2026-03-27 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 085701環(huán)境工程，267求調(diào)劑 +16 | minht 2026-03-26 | 16/800 |
|
|
|
[考研] 085701環(huán)境工程求調(diào)劑 +9 | 多久上課 2026-03-27 | 9/450 |
|
|
|
[考研] 286求調(diào)劑 +4 | lim0922 2026-03-26 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑，一志愿 南京航空航天大學(xué)大學(xué) ，080500材料科學(xué)與工程學(xué)碩 +4 | @taotao 2026-03-26 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 351求調(diào)劑 +4 | 麥克阿磊 2026-03-24 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 生物學(xué) 296 求調(diào)劑 +4 | 朵朵- 2026-03-26 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 289求調(diào)劑 +17 | 碩星赴 2026-03-23 | 17/850 |
|
|
|
[考研] 0854AI CV方向招收調(diào)劑 +4 | 章小魚567 2026-03-23 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 285求調(diào)劑 +3 | AZMK 2026-03-24 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 318求調(diào)劑 +3 | plum李子 2026-03-23 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 344求調(diào)劑 +3 | desto 2026-03-24 | 3/150 |
|