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ontoresinc
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多肽-肽庫(kù)合成 已有1人參與
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肽庫(kù)（Peptide library）： 是一組大量的幾百萬(wàn)甚至更多的順序排列多肽，即該長(zhǎng)度肽的氨基酸序列的排列組合。組合化學(xué)（Combinatorial chemistry, CC）結(jié)合高通量篩選（High throughout screening, HTS）技術(shù)在一種快速有效的合成和篩選大量分子的方法。 最簡(jiǎn)單的組合肽庫(kù)是平行肽庫(kù)（Parallel library），此肽庫(kù)中的每一種序列的肽都是在單獨(dú)的反應(yīng)器中合成的，保證了肽庫(kù)的質(zhì)量。這種方法合成量小，可以通過(guò)自動(dòng)化和微波技術(shù)提高效率 第二種肽庫(kù)是隨機(jī)肽庫(kù)（Random library），每個(gè)反應(yīng)器中生成上百萬(wàn)條不同序列的肽，從而便于快速篩選大量的肽。 隨機(jī)肽庫(kù)的合成(Split and Mix & Pre-mix methods) 合成隨機(jī)多肽有兩種方法。第一種是Split and Mix，該方法分為三個(gè)基本步驟：平分（Split）、偶聯(lián)（Couple）和混合（Mix）。首先平分，將樹(shù)脂球平分為若干等份，等份數(shù)量與肽庫(kù)的氨基酸種類相同；其次偶聯(lián)，每一等份加入一份特定對(duì)應(yīng)的氨基酸組份進(jìn)行徹底反應(yīng)；最后混勻，這一步將所有等份完全混勻。然后重新平分為與之前相同數(shù)目的等份，這樣可以得到均勻的等量的多肽混合物。重復(fù)這三個(gè)基本步驟N次（N為一條目標(biāo)肽的氨基酸個(gè)數(shù)），可以快速生成一系列新分子，而樹(shù)脂球數(shù)量不變。樹(shù)脂球每次只與一種反應(yīng)物反應(yīng)，每個(gè)樹(shù)脂球只會(huì)產(chǎn)生一種化合物（One-bead one-compound：OBOC library，一樹(shù)脂球一種肽）。由于每一次都是完全反應(yīng)，所以混合物中所有的多肽都是等比例的。除去保護(hù)基團(tuán)后，樹(shù)脂球上的多肽便可以用于測(cè)試。 Pre-mix 由于OBOC方法合成較大的肽庫(kù)存在其局限性，常用氨基酸預(yù)混合液的方法合成混合肽庫(kù)。這種方法中的用于肽庫(kù)合成的氨基酸是提前混合的然后偶聯(lián)到一批樹(shù)脂球上。在偶聯(lián)最后一個(gè)氨基酸之前，將樹(shù)脂球平分為N等份（此N等于肽庫(kù)中氨基酸種類的數(shù)量），然后分別添加一種氨基酸進(jìn)行反應(yīng)。這樣可以得到N末端殘基標(biāo)志的子庫(kù)。因?yàn)槊總�(gè)樹(shù)脂球都是在相同的環(huán)境下同相同的試劑進(jìn)行反應(yīng)的，所有這種方法合成的肽庫(kù)其每個(gè)樹(shù)脂球上都有子庫(kù)的所有肽的集合。 定位肽庫(kù)（Positional Peptide Library） 在多肽序列的某個(gè)特定位點(diǎn)被系統(tǒng)的用其他不同的氨基酸取代，以研究特定位置替代氨基酸的作用。通過(guò)測(cè)定活性的相應(yīng)增加，可以判定在這些位點(diǎn)的最優(yōu)氨基酸。 重疊肽庫(kù)（Overlapping Peptide Library） 這種肽庫(kù)是由特定肽長(zhǎng)（Peptide Length）和步移（Offset Number）的首尾相搭的肽組成，這些肽覆蓋完整天然蛋白的全序列，此方法用于篩選線性連續(xù)性表位圖譜和T-細(xì)胞表位。 Ala篩選庫(kù)（Alanine Peptide Scanning Library） 在此類肽庫(kù)中丙氨酸系統(tǒng)地取代確定的表位中的每一個(gè)氨基酸，這種方法用于鑒定多肽各個(gè)位點(diǎn)對(duì)其活性的必要性。 截頭肽庫(kù)（Truncation Peptide Library） 此類肽庫(kù)用于確定最優(yōu)表位活性的所需的最少氨基酸長(zhǎng)度，建立的方法是系統(tǒng)地除去原多肽中兩端的氨基酸而得到的一些列多肽。 亂序肽庫(kù)（Scrambled Peptide Library） 此類肽庫(kù)的構(gòu)建是通過(guò)產(chǎn)生原有多肽序列的全部重新排列而得，其氨基酸組成與原肽相同但序列不同，可以得到所有可能的替代選擇和提供突變程度最高的多肽庫(kù)。 原文地址：http://blog.sina.com.cn/s/blog_132fb62500102w2zb.html |
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