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吉米愛(ài)多鐵桿木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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[求助]
關(guān)于Gromacs壓力耦合方式的設(shè)置
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附圖中，“蒙脫石+水”圖是我的模擬體系。我用NPT預(yù)平衡的時(shí)候，采用了semi--isotropic的壓力耦合，發(fā)現(xiàn)實(shí)際壓力距離設(shè)定值差別很大（“壓力”圖），Z方向的壓力基本和設(shè)定的500bar接近，但是在X/Y方向，壓力距離設(shè)定的500bar差得很遠(yuǎn)。“mdp參數(shù)”圖是我的壓力耦合這塊的參數(shù)。 請(qǐng)教各位，有沒(méi)有設(shè)置過(guò)semiisotropic的，可否借鑒下你們這塊壓力耦合的設(shè)置？ mdp參數(shù).jpg 蒙脫石+水.jpg 壓力.jpg |
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月燈三昧
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2樓2016-11-21 22:08:38
最愛(ài)馬良
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3樓2018-10-30 09:20:42
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