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tianflame金蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
求助 對(duì)受體蛋白做定向進(jìn)化/虛擬氨基酸突變以提高與配體的親和力 哪個(gè)軟件好 已有1人參與
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大家好： 目前我在研究一個(gè)配體-受體結(jié)合的體系，配體結(jié)構(gòu)固定，我需要將受體的binding site氨基酸進(jìn)行飽和突變（大概6、7個(gè)氨基酸），從中篩選出能夠增強(qiáng)與配體親和力的突變組合，請(qǐng)問(wèn)以下軟件哪個(gè)最好：DS，MOE，Schrodinger，或者還有其他更好的軟件推薦也行，最好是Windows系統(tǒng)下的。 我查到文獻(xiàn)上用MM/PBSA的方法計(jì)算binding energy以此判斷親和力的大小，請(qǐng)問(wèn)這個(gè)方法是目前為止最好的方法嗎？是否有更好的方法？以上軟件哪個(gè)可以使用這種方法？ 謝謝大家！ |
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2樓2016-01-15 11:59:30
好模擬
新蟲(chóng) (初入文壇)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 23
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- 蟲(chóng)號(hào): 4446375
- 注冊(cè): 2016-02-29
- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
3樓2016-03-01 13:40:45
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chemyang.ccnu.edu.cn/AUTO_CMS/ 這個(gè)做抗性預(yù)測(cè)的服務(wù)器，我們課題組做的，你可以看看！ 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
4樓2016-03-03 00:38:45
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