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A Guide to QTL Analysis in GenStat 書籍分享(已經(jīng)搜索,無重復(fù))
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初步翻譯一下目錄: 1 GenStat軟件定位QTL系統(tǒng)初步介紹 1.1 GenStat定位QTL的方法:連鎖分析和關(guān)聯(lián)分析 1.2 窗口視圖 1.3 例子介紹,CIMMTY的玉米F2數(shù)據(jù),小麥數(shù)據(jù),大麥數(shù)據(jù) 1.4 定位的pipeline 2 導(dǎo)入和檢測表型數(shù)據(jù)和基因型數(shù)據(jù) 3 帶試驗設(shè)計的表型數(shù)據(jù)如何分析 3.1 單環(huán)靜 3.2 性狀均值 3.3 計算遺傳力 3.4 -3.8 各種試驗設(shè)計的數(shù)據(jù),不如隨機區(qū)組、不完全區(qū)組、空間分析等 4 多環(huán)境QTL定位分析 4.1 基因型與環(huán)境互作 4.2 多年多點數(shù)據(jù)的分析 4.3 方差協(xié)方差模型(Identity、Compound symmetry、Diagonal、Factor analytic of order k等) 4.4-4.5 基因與環(huán)境互作(AMMI模型、GGE biplot模型) 5 構(gòu)建圖譜 5.1 重組數(shù) 5.2 分組 5.3 構(gòu)建圖譜 6 單環(huán)境單位點QTL定位分析 7 多性狀單環(huán)境QTL分析、單性狀多環(huán)境QTL分析 8 cross pollinate群體,即是cp群體,雙親為F1雜合的QTL定位方法 9 關(guān)聯(lián)分析,包括系譜信息、分組信息、多性狀多環(huán)境關(guān)聯(lián)分析 10 介紹線性混合模型 10.1 線性混合模型 10.2 理解隨機因子 10.3 更加復(fù)雜的隨機因子結(jié)構(gòu) 10.4 隨機模型的比較標(biāo)準(zhǔn) 10.5 隨機因子的預(yù)測,最佳線性無偏預(yù)測(blup) 10.6 評價固定因子 107 模型檢測和適合性檢測 10.8 混合線性模型的分析流程 |
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