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yuilyamada木蟲 (小有名氣)
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[求助]
MMPBSA數(shù)據(jù)分析？IC50？
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我在做amber教程上面的mmpbsa時，看不懂輸出結(jié)果FINAL_RESULTS_MMPBSA.dat，http://ambermd.org/tutorials/adv ... script/section2.htm，其中GENERALIZED BORN和POISSON BOLTZMANN有什么不同？怎么用這些數(shù)據(jù)求IC50？還有GB與PB到底有什么不同？我跑某些體系的加熱時水盒子會有凹進去現(xiàn)象（很明顯），但是平衡時又會回來，大家出現(xiàn)過這樣的現(xiàn)象嗎？可能是什么原因呢？ 不好意思，新手，問題可能有點多，麻煩大家指教呢，謝謝 |
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