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gy_xmc2015銅蟲 (小有名氣)
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傅向東綜述:非編碼RNA——調(diào)控生物學(xué)的前沿領(lǐng)域
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非編碼RNA——調(diào)控生物學(xué)的前沿領(lǐng)域 http://nsr.oxfordjournals.org/content/1/2/190.full http://paper.sciencenet.cn/htmlpaper/201512615235392135557.shtm 生命從來都不是一個靜態(tài)的過程。微觀如分子、復(fù)合物、細胞,宏觀如組織、器官、個體,一直處于交流和動態(tài)調(diào)控的狀態(tài)。加州大學(xué)圣地亞哥分校的傅向東教授撰寫綜述文章“Non-coding RNA: a new frontier in regulatory biology”,從非編碼RNA(ncRNA)的角度綜述概括了ncRNA在調(diào)控生物學(xué)中的重要作用。 發(fā)現(xiàn)基因組中大量非編碼序列是測序技術(shù)帶來的驚喜之一。在人類基因組中,編碼序列只占基因組的1.5%,大量非編碼RNA的功能與存在意義吸引了科研界的巨大關(guān)注,并取得了令人矚目的進展。本綜述不側(cè)重于列舉ncRNA從機制研究到生物學(xué)功能的具體細節(jié),相反的,通過將ncRNA與調(diào)控生物學(xué)的另一主要成員蛋白質(zhì)家族相比,揭示ncRNA在調(diào)控生物學(xué)中的獨特性,并對其在生物醫(yī)學(xué)和生物技術(shù)中的應(yīng)用進行展望。 該綜述指出,ncRNA通過多樣化的方式發(fā)揮著調(diào)控作用:(1)RNA作為酶可以催化反應(yīng),如自催化剪接的內(nèi)含子;(2)RNA可作為分子骨架調(diào)節(jié)RNA/DNA/蛋白質(zhì)之間的相互作用; (3)順式作用RNA作為調(diào)控信號;(4)反式作用RNA作為分子sink,如假基因或者mRNA的某些元件可以起到競爭性緩沖的調(diào)節(jié)作用;(5)RNA作為配體,結(jié)合靶蛋白,引起蛋白構(gòu)象變化,觸發(fā)下一步生物學(xué)過程;(6)RNA作為細胞結(jié)構(gòu)的組織者,如大ncRNA分子NEAT-1定位于細胞核特定區(qū)域,在組織基因組協(xié)調(diào)轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)錄后加工事件中扮演角色;(7)分泌型RNA可以作為潛在激素信號分子分泌到胞外,對循環(huán)系統(tǒng)分泌miRNA 的檢測可能提供一個獨特疾病診斷標(biāo)志物。 鑒于ncRNA在調(diào)控中的重要作用, 文章評述和展望了ncRNA的功能和機制研究的方法。由于ncRNA作為長鏈核酸分子的獨特性,以及形成二級結(jié)構(gòu)三級結(jié)構(gòu)的能力,對于其結(jié)構(gòu)和作用功能的研究需要新的手段,如CHAT-seq,ChIRP-seq,cross-linking IP,RNP重構(gòu)及結(jié)構(gòu)解析,基因組編輯方法TALEN,CRISPR等。同時,文章指出,ncRNA的研究數(shù)據(jù)需同基因組和蛋白組數(shù)據(jù)有機整合,才能更好的詮釋ncRNA的功能。 |
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