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yalefield金蟲 (文壇精英)
老漢一枚
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[交流]
關(guān)于QSAR原理的書籍
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俺在壇子里發(fā)過一些關(guān)于QSAR理論和趨勢的綜述性文獻(xiàn)，但很少發(fā)具體的例子。 其實，正是QSAR思想使化學(xué)之所以是科學(xué)而不是巫術(shù)。如果分子的結(jié)構(gòu)與性能之間沒有規(guī)律，我們作為化學(xué)家還能干什么？ QSAR方法的本質(zhì)，是統(tǒng)計學(xué)。更具體地說，是建立在統(tǒng)計基礎(chǔ)之上的模式識別。目前所有化學(xué)類的書籍，對此都是語焉未詳。李仁利的那本書，還算比較專業(yè)，例子很豐富。此外，化學(xué)計量學(xué)的幾本書，也談了一些，但內(nèi)容都比較淺，特別是在數(shù)學(xué)/統(tǒng)計學(xué)基礎(chǔ)上，對化學(xué)領(lǐng)域的讀者來說，沒什么參考價值。能看懂的人，嫌它太淺，說明不了問題；看不懂的，則嫌它太深。 因此，你如對QSAR思想感興趣，并且要想從原理/方法上提高自己的水平，可以看看電子工業(yè)出版社的兩本書：《統(tǒng)計學(xué)習(xí)基礎(chǔ)》、《統(tǒng)計模式識別》，都是翻譯過來的。 以前的帖子： 呵呵，先上兩盤QSAR老菜：有機結(jié)構(gòu)體積的加合性 http://www.gaoyang168.com/html/200711/622533.html 再嘗嘗“去火”的苦算子： http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=622535 [ Last edited by woshilsh on 2009-6-13 at 22:15 ] |
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2樓2008-10-04 10:44:29
yalefield
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3樓2008-10-04 12:25:01
yelverxm
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4樓2008-10-06 02:54:45
jinlei
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前輩你好 您的很多帖子我已經(jīng)拜讀過了 我本人是搞藥物化學(xué)的 主要研究的是有機合成這一塊 但每天都是在實驗室里盲目的搞些重復(fù)的合成實驗 時間長了東西倒是很多但總覺得這樣搞下去沒有什么指導(dǎo)性 很累人不說 到頭來三年只是一直在拚命的合成 我現(xiàn)在馬上就要研三了 前不久在聽一次報告時偶然接觸了QSAR 覺得有點相見恨晚的感覺 回來后這幾天就一直在找這方面的資料在看 之前找了不少資料書籍 大都是在講關(guān)于統(tǒng)計方面的數(shù)學(xué)知識 看得我云里霧里 后來看了您的帖子 拜讀了李老師的 藥物構(gòu)效關(guān)系 受益非淺 對基本的2D-QSAR有了一些了解 但還是覺得不知道該如何下手 再過一陣子就要開始寫畢業(yè)論文了 我想把自己這兩年多來作的幾十個化合物利用2D-QSAR作一下簡單的規(guī)律性的總結(jié) 希望前輩能夠幫我指點一下 有沒有什么建議可以幫我提一下 鑒于以前沒有過相關(guān)的研究經(jīng)驗 您是否可以給我推薦幾種比較容易上手的軟件并希望您能簡單介紹一下這些軟件在研究QSAR方面究竟是做什么用的 可能我提的這些問題有些幼稚還希望前輩諒解 見笑見笑 [ Last edited by jinlei on 2009-6-11 at 16:51 ] |
5樓2009-06-11 16:49:24
whitewatercn
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數(shù)理功底不太好的，可以先看一些搞化學(xué)的人寫的統(tǒng)計方面的書，結(jié)合具體的化學(xué)問題，比較容易理解，如： 許祿： 化學(xué)計量學(xué) 羅旭：化學(xué)統(tǒng)計學(xué) 陳念貽：模式識別方法在化學(xué)化工中的應(yīng)用 有了一定理解和實踐后，可以看一些更專業(yè)點的，如 邊肇祺：模式識別 張學(xué)工（譯）：統(tǒng)計學(xué)習(xí)的本質(zhì) 商業(yè)軟件做得太好，帶來的一大缺點就是不求甚解，誤人子弟。比如CoMFA,容易上手吧？只要跟著教程操作幾遍就會了。后果呢？有人用了三年的CoMFA,結(jié)果論文送審時連最基本的關(guān)于PLS的問題都回答不了，跑來問我這個CoMFA只用過兩星期的人。 也有的人， 聚類分析軟件用了幾年，連什么叫single linkage都不知道。悲乎？ |
6樓2009-06-12 08:48:40
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