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[求助]
應(yīng)當(dāng)如何設(shè)置nvt nve npt 系綜？ 已有2人參與
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比如 ： ------------------------------------------------------------------ fix 1 all npt temp 2.5 2000 4.00 x 0.0 0.0 6.0 drag 0.2 run 100000 ------------------------------------------------------------------- 2000是目標(biāo)的溫度，那前面的2.5是如何得來的？ 計(jì)算的步數(shù)有什么要求沒，是不是需要實(shí)時(shí)調(diào)整，如果到100000步還沒達(dá)到2000k時(shí)是不是要繼續(xù)計(jì)算下去？ 如果達(dá)到了2000K應(yīng)該要再保持多久？ |
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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fix里面的溫度只是target溫度,具體來說就是決定你熱浴下動(dòng)力學(xué)方程的那個(gè)參數(shù). 打個(gè)比方 fix 1 all nvt temp 2.5 2000 4.00 run 100 那么這個(gè)時(shí)候第一步對(duì)應(yīng)的熱浴溫度為2.5K,第一百部為2000K,中間線性插值 然而具體你的體系和這個(gè)熱浴接觸能到多少度就看你自己測(cè)試了,也許能熱平衡,也許不能 調(diào)壓得時(shí)候有的體系溫度波動(dòng)很大,比較難調(diào)溫,比如一些amorphous相. |
» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）
完全是火2樓2016-01-23 18:05:59
luftf
木蟲 (正式寫手)
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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2.5是你自己定義的熱浴初始溫度 2000是你自己定義的熱浴終止溫度 將系統(tǒng)總能量隨時(shí)間步的增長(zhǎng)曲線輸出，如果系統(tǒng)能量已經(jīng)波動(dòng)不大，說明弛豫效果較好，可以停止了 |
3樓2016-01-23 19:52:25
4樓2016-01-24 14:30:49
5樓2016-01-24 14:32:53
6樓2016-01-24 16:10:08
7樓2016-01-24 19:39:22
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