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xiemeng101新蟲 (小有名氣)
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wfn畫nbo軌道 求助
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我想用wfn畫nbo軌道。是參照使Sobereva寫的《用Multiwfn繪制NBO及相關(guān)軌道 》里提到的方法，文中提到：“注意fch文件中的軌道編號(hào)和Gaussian的NBO 3.1模塊(L607)顯示的軌道編號(hào)不全一致，在存入fch文件時(shí)會(huì)進(jìn)行重排，NBO模塊輸出信息末尾的Sorting of NBOs和Reordering of NBOs for storage部分顯示的序號(hào)是重排前后的對(duì)應(yīng)關(guān)系“。 我想畫的是 87. LP ( 1) N 18 /510. BD*( 1)Se 11 -Br 12 E(2) =26.44 即 第 87號(hào)軌道 N的孤對(duì)電子與第 510 號(hào)軌道 Se-Br反鍵之間的軌道重疊作用。 檢查了軌道重排前后的變化，發(fā)現(xiàn)沒(méi)有這兩個(gè)都沒(méi)有發(fā)生重排。但是，在用wfn畫這兩軌道時(shí)，發(fā)現(xiàn)好像都不是對(duì)應(yīng)的軌道，如下圖表示：87號(hào)對(duì)應(yīng)的卻是 吡啶環(huán)上C13-C14的軌道，510號(hào)軌道卻是苯環(huán)上的軌道。而且，兩者之間沒(méi)有軌道重疊的現(xiàn)象。 不知道是怎么回事？急求答案。 87號(hào)軌道 87和510軌道都存在的圖 重排前 重排后 510號(hào)軌道 重排前后的比較 |
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小范范1989
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3樓2016-01-26 19:33:31
xiemeng101
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已找到原因：在《使用Multiwfn繪制NBO及相關(guān)軌道 (2)》中，Sobereva 寫到： 注意fch文件中的軌道編號(hào)和Gaussian的NBO 3.1模塊(L607)顯示的軌道編號(hào)通常不一致。比如在NBO輸出信息最后顯示 Reordering of NBOs for storage: 7 8 3 1 2 4 6 5 9 38 ... 那么就是說(shuō)明chk/fch文件里的1號(hào)軌道對(duì)應(yīng)于NBO7，2號(hào)軌道對(duì)應(yīng)NBO8，3號(hào)軌道對(duì)應(yīng)NBO3，4號(hào)軌道對(duì)應(yīng)NBO1...無(wú)論你用gview看這個(gè)chk文件，還是用Multiwfn看相應(yīng)的fch文件，當(dāng)你選比如第2號(hào)軌道，顯示的都是NBO8。 是軌道的對(duì)應(yīng)關(guān)系弄錯(cuò)了。希望這個(gè)問(wèn)題對(duì)大家也有幫助。  |
2樓2016-01-26 14:49:50
小范范1989
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4樓2016-01-26 19:34:46
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5樓2016-01-27 11:14:39
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