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jinbei木蟲 (正式寫手)
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[求助]
高斯09優(yōu)化中途終止計(jì)算，log文件提示內(nèi)存問題 已有1人參與
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高斯09優(yōu)化離子液體的結(jié)構(gòu)時(shí)，計(jì)算到中途時(shí)出現(xiàn)問題，計(jì)算終止，輸出文件.log文件（不是終端）里面最后一行出現(xiàn)“galloc: could not allocate memory.”這句號，計(jì)算到中途為何出現(xiàn)無法分配內(nèi)存呢？ 之前由于輸入文件“%mem=5500MW”內(nèi)存設(shè)置為5500MW，優(yōu)化時(shí)在終端出現(xiàn)“galloc: could not allocate memory.: Cannot allocate memory galloc”提示，此時(shí)，直接調(diào)整“%mem=4000MW”后即可正常運(yùn)行。（服務(wù)器有32CPU，32G內(nèi)存，紅帽LINUX系統(tǒng)） （1）下面是輸入文件.gjf的頭幾行（全部見附件）。 %nprocshared=2 %mem=4000MW %chk=05-Ps-mim_p-TSA_front_-opt-freq.chk # opt freq ub3lyp/6-311++g(d,p) pop=(nbo,savemixed) geom=connectivity （2）下面是輸出文件.log的最后幾行（全部見附件）。 Initial guess <Sx>= 0.0000 <Sy>= 0.0000 <Sz>= 0.0000 <S**2>= 0.0000 S= 0.0000 Harris functional with IExCor= 402 diagonalized for initial guess. ExpMin= 3.60D-02 ExpMax= 9.34D+04 ExpMxC= 3.17D+03 IAcc=3 IRadAn= 0 AccDes= 0.00D+00 HarFok: IExCor= 402 AccDes= 0.00D+00 IRadAn= 0 IDoV= 1 ScaDFX= 1.000000 1.000000 1.000000 1.000000 FoFCou: FMM=F IPFlag= 0 FMFlag= 100000 FMFlg1= 0 NFxFlg= 0 DoJE=T BraDBF=F KetDBF=T FulRan=T Omega= 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 ICntrl= 500 IOpCl= 0 NMat0= 1 NMatS0= 1 NMatT0= 0 NMatD0= 1 NMtDS0= 0 NMtDT0= 0 I1Cent= 4 NGrid= 0. Petite list used in FoFCou. Requested convergence on RMS density matrix=1.00D-08 within 128 cycles. Requested convergence on MAX density matrix=1.00D-06. Requested convergence on energy=1.00D-06. No special actions if energy rises. SCF Done: E(UB3LYP) = -1903.00239220 A.U. after 14 cycles Convg = 0.3940D-08 -V/T = 2.0028 <Sx>= 0.0000 <Sy>= 0.0000 <Sz>= 0.0000 <S**2>= 0.0000 S= 0.0000 <L.S>= 0.000000000000E+00 Annihilation of the first spin contaminant: S**2 before annihilation 0.0000, after 0.0000 DiagDN has N= 684 LTot= 2084 but NE2= 3 cannot use DSYEVD. Calling FoFJK, ICntrl= 2127 FMM=F ISym2X=0 I1Cent= 0 IOpClX= 1 NMat=1 NMatS=1 NMatT=0. galloc: could not allocate memory. |
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- 附件 2 : 05-Ps-mim_p-TSA_front_-opt-freq.gjf
2016-02-20 08:30:13, 4.94 M
2016-02-20 08:33:26, 7.68 K
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jinbei
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