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yuexiaoming新蟲 (小有名氣)
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[求助]
關(guān)于fix deposit 命令疑惑 已有2人參與
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| 本人打算用fix deposit命令做一些沉積的模擬,程序能夠運(yùn)行,也能夠顯示出沉積原子數(shù)目不斷增加,但是就是輸出不了沉積原子的信息,也就是dump不出來(lái),請(qǐng)問(wèn),有沒(méi)有人知道如何解決? |
新蟲 (小有名氣)
木蟲 (正式寫手)
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是不是dump的時(shí)候用的的是custom,或者是atom? 是不是用vmd看的結(jié)果? 如果是的話,你的dump文件其實(shí)包含了新的原子,只是vmd不支持原子數(shù)變化的文件。 解決方法: dump 類型用xyz, 比如 dump 1 all xyz 10 dump.xyz 然后,用vmd讀入 topo readvarxyz dump.xyz |
新蟲 (小有名氣)
銅蟲 (小有名氣)
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