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pdl9527專(zhuān)家顧問(wèn) (小有名氣)
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[求助]
MS的Dmol3模塊COSMO計(jì)算的問(wèn)題。 已有1人參與
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我在別的區(qū)提過(guò)了，沒(méi)人解答。。。。 http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=7397241 |
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胡延杰
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27樓2017-07-17 15:27:19
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gkf高: 金幣+4 2014-05-13 16:14:05
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雖然我對(duì)溶劑化了解的不多，昨天剛剛和人討論過(guò)這個(gè)問(wèn)題，趕上得很是時(shí)候。 ppt結(jié)尾引用了文獻(xiàn)Klamt, Andreas, G. Shüürmann的，這個(gè)似乎對(duì)應(yīng)的是Dmol3老的溶劑化計(jì)算方法（Dmol3的help能夠查到），這種方法計(jì)算sigma的時(shí)候和新方法（默認(rèn)的ibs）不一樣，我們發(fā)覺(jué)空穴孔洞面積確實(shí)不同。如果要在Dmol3中實(shí)現(xiàn)Klamt方法，應(yīng)該先保存input文件（Dmol3 Calculations-(其他參數(shù)設(shè)定完成)-Files-save files，然后產(chǎn)生input文件），然后把COSMO那一行的ibs修改成on，然后在Dmol3 Calculations-Files-run files運(yùn)行。 即便這樣，我不太確定每個(gè)原子的溶劑化半徑在兩個(gè)程序（你給出的ppt和Dmol3）中是否相同。不過(guò)仍舊建議你做個(gè)測(cè)試進(jìn)行比較。 |
2樓2014-05-13 13:16:48
pdl9527
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不好意思我那個(gè)附件傳錯(cuò)了，這地方又傳看一邊：http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=7402423 請(qǐng)?jiān)趲兔纯�，他的COSMO是ON的狀態(tài)的~ |
3樓2014-05-13 18:25:45
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4樓2014-05-13 19:59:31
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