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pdl9527專家顧問 (小有名氣)
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[求助]
MS的Dmol3模塊COSMO計算的問題。 已有1人參與
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我在別的區(qū)提過了,沒人解答。。。。 http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=7397241 |
專家顧問 (小有名氣)
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專家經(jīng)驗: +8 |
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不好意思我那個附件傳錯了,這地方又傳看一邊:http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=7402423 請在幫忙看看,他的COSMO是ON的狀態(tài)的~ |
專家顧問 (著名寫手)
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專家經(jīng)驗: +224 |
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雖然我對溶劑化了解的不多,昨天剛剛和人討論過這個問題,趕上得很是時候。 ppt結(jié)尾引用了文獻(xiàn)Klamt, Andreas, G. Shüürmann的,這個似乎對應(yīng)的是Dmol3老的溶劑化計算方法(Dmol3的help能夠查到),這種方法計算sigma的時候和新方法(默認(rèn)的ibs)不一樣,我們發(fā)覺空穴孔洞面積確實不同。如果要在Dmol3中實現(xiàn)Klamt方法,應(yīng)該先保存input文件(Dmol3 Calculations-(其他參數(shù)設(shè)定完成)-Files-save files,然后產(chǎn)生input文件),然后把COSMO那一行的ibs修改成on,然后在Dmol3 Calculations-Files-run files運行。 即便這樣,我不太確定每個原子的溶劑化半徑在兩個程序(你給出的ppt和Dmol3)中是否相同。不過仍舊建議你做個測試進(jìn)行比較。 |

專家顧問 (著名寫手)
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