 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 5 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 2749 | 回復(fù): 8 | ||
| 當(dāng)前只顯示滿足指定條件的回帖，點擊這里查看本話題的所有回帖 | ||
cgdsbsd新蟲 (初入文壇)
|
[求助]
葉綠體序列拼接 已有1人參與
|
|
|
我現(xiàn)在有基因組數(shù)據(jù)、轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，怎么提取出葉綠體基因，并且拼接成一個圓環(huán)��？ 我開始是想先用一個從NCBI上下載的一個相近物種的葉綠體基因做reference，然后用soap2把基因組序列mapping到reference上，篩選出可能是葉綠體的短read，用soapdenovo將這些read拼接成contig，然后用BWA mapping在reference上，看有多少gap ，在gap兩端設(shè)計引物做PCR，將gap補滿，不知道這個思路對不對？ 現(xiàn)在我得出的短read都是單序列，沒有成對的，然后從頭合成拼接的時候生成2500多條contig,而且最長的才300多bp，沒有scafer生成，下一步不知道該怎么繼續(xù)了，很茫然，請各位大牛幫忙，謝謝。。。 |
回復(fù)此樓» 猜你喜歡
306求0703調(diào)劑一志愿華中師范
已經(jīng)有9人回復(fù)
-
一志愿吉大化學(xué)322求調(diào)劑
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
求調(diào)劑
已經(jīng)有5人回復(fù)
-
344求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
一志愿哈工大，085400，320，求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
【考研調(diào)劑】化學(xué)專業(yè) 281分，一志愿四川大學(xué)，誠心求調(diào)劑
已經(jīng)有13人回復(fù)
-
307求調(diào)劑
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
【雙一流院校新能源、環(huán)境材料，材料加工與模擬招收大量調(diào)劑】
已經(jīng)有6人回復(fù)
-
26申博自薦
已經(jīng)有3人回復(fù)
-
資源與環(huán)境 調(diào)劑申請(333分)
已經(jīng)有6人回復(fù)
» 本主題相關(guān)價值貼推薦，對您同樣有幫助:
- 公司返回的雙向測通的序列個人如何拼接��？
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 基因定位--葉綠體-線粒體-細(xì)胞核？？？
已經(jīng)有12人回復(fù)
- 請教：葉綠體、線粒體、細(xì)胞核DNA的相互關(guān)系
已經(jīng)有7人回復(fù)
- 求助葉綠體線粒體分離提取
已經(jīng)有11人回復(fù)
- 問有人會提葉綠體蛋白組嗎？�。ㄓ衩赘茫�
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 【程序】Photoshop cs5的序列號生成器
已經(jīng)有44人回復(fù)
- 【求助/交流】為什么用拼接軟件，不能將我的序列拼接起來？
已經(jīng)有9人回復(fù)
- 【求助/交流】懇求：如何進(jìn)行序列拼接
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 【求助/交流】幾個序列的拼接
已經(jīng)有10人回復(fù)
- 【求助/交流】跪求小麥葉綠體DNA的提取方法
已經(jīng)有5人回復(fù)
- [緊急求助]Matlab中的圖像拼接
已經(jīng)有8人回復(fù)
- 求助葉綠體基因組提取方法
已經(jīng)有3人回復(fù)
- 【分享】測序結(jié)果拼接軟件ContigExpress程序及使用方法
已經(jīng)有128人回復(fù)
8樓2016-06-05 17:13:48
mycaas
鐵桿木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 13 (小學(xué)生)
- 金幣: 6366.6
- 散金: 801
- 紅花: 6
- 帖子: 586
- 在線: 549小時
- 蟲號: 654016
- 注冊: 2008-11-14
- 性別: GG
- 專業(yè): 科學(xué)社會主義
2樓2012-07-27 17:06:54
xiaokoupu
銀蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 2 (幼兒園)
- 金幣: 325.5
- 散金: 15
- 帖子: 66
- 在線: 32.3小時
- 蟲號: 1077764
- 注冊: 2010-08-19
- 性別: GG
- 專業(yè): 生物信息學(xué)
3樓2012-07-28 21:53:02
cgdsbsd
新蟲 (初入文壇)
- 應(yīng)助: 1 (幼兒園)
- 金幣: 12.5
- 帖子: 23
- 在線: 10小時
- 蟲號: 1684311
- 注冊: 2012-03-12
- 性別: GG
- 專業(yè): 生物信息學(xué)
4樓2012-07-30 10:07:29
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 298-一志愿中國農(nóng)業(yè)大學(xué)-求調(diào)劑 +11 | 手機(jī)用戶 2026-03-17 | 12/600 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 291求調(diào)劑 +8 | hhhhxn.. 2026-03-23 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 269求調(diào)劑 +4 | 我想讀研11 2026-03-23 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 333求調(diào)劑 +3 | ALULU4408 2026-03-23 | 3/150 |
|
|
[考研] 336化工調(diào)劑 +4 | 王大坦1 2026-03-23 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑一志愿武漢理工大學(xué)材料工程（085601） +3 | WW.' 2026-03-23 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 289求調(diào)劑 +7 | 懷瑾握瑜l 2026-03-20 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 廣西大學(xué)材料導(dǎo)師推薦 +3 | 夏夏夏小正 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 考研調(diào)劑 +3 | 呼呼？~+123456 2026-03-21 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 材料工程專碩 348分求調(diào)劑 +3 | 冬辭. 2026-03-17 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 材料學(xué)碩333求調(diào)劑 +3 | 北道巷 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 307求調(diào)劑 +3 | wyyyqx 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 083200學(xué)碩321分一志愿暨南大學(xué)求調(diào)劑 +3 | innocenceF 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿重慶大學(xué)085700資源與環(huán)境專碩，總分308求調(diào)劑 +3 | 墨墨漠 2026-03-18 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 274求調(diào)劑 +10 | S.H1 2026-03-18 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 考研調(diào)劑求學(xué)校推薦 +3 | 伯樂29 2026-03-18 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 中南大學(xué)化學(xué)學(xué)碩337求調(diào)劑 +3 | niko- 2026-03-19 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 086500 325 求調(diào)劑 +3 | 領(lǐng)帶小熊 2026-03-19 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 0703化學(xué)調(diào)劑 +4 | 18889395102 2026-03-18 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 本科鄭州大學(xué)物理學(xué)院，一志愿華科070200學(xué)碩，346求調(diào)劑 +4 | 我不是一根蔥 2026-03-18 | 4/200 |
|