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趙紅霞鐵桿木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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[求助]
MS粗粒化模型如何導(dǎo)入lammps 已有2人參與
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如題，我在MS里建立聚合物的粗�；Ｐ�，并用martini分配力場(chǎng)，但是不知道如何轉(zhuǎn)化為lammps所需要的文件，請(qǐng)高手指教 本人做溶液環(huán)境下聚合物鏈的自組裝，有幾個(gè)問(wèn)題請(qǐng)教（問(wèn)題1,2,3,是同樣的問(wèn)題，我怕說(shuō)不清楚所以分條說(shuō)） 1. 做多條鏈的自組裝，在MS里建粗�；木酆衔镦�，是建一條鏈導(dǎo)入lammps，然后用命令可以建出多條鏈， 還是直接需要在MS里建多條鏈然后導(dǎo)入到lammps？ 2. 關(guān)于溶液的問(wèn)題，這個(gè)和問(wèn)題1類似，比如我要建水分子的粗�；�，是只要建一個(gè)水珠子還是需要直接建N個(gè)水珠子再導(dǎo)入？ 3. 在MS里分別建好各個(gè)分子，導(dǎo)入lammps，在lammps里組裝，還是直接先在MS里組裝好，粗�；�，再直接導(dǎo)入lammps？ 4. 在MS里保存成什么文件類型，在哪里用什么命令轉(zhuǎn)化？轉(zhuǎn)化之后如何查看初始模型？ |
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趙紅霞
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9樓2017-12-03 10:32:48
趙紅霞
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