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關(guān)于DNA連接的納米粒子自組裝的分子動力學模擬，求交流和分享 已有1人參與
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| 本人所選課題暫定“模擬基于DNA連接的納米粒子的自組裝”，由于各種困難，包括構(gòu)建合適的DNA粗粒化模型，這個研究方向在學術(shù)界一直都進展緩慢，主要是以實驗為主，并且絕大數(shù)工作都依賴于美國西北大學著名的C. A. Mirkin教授的研究團隊，一直到2011年，美國愛荷華州立大學的A. Travesset教授和C. Knorowski教授與路易斯安那州立大學的S. Burleigh合作才正式開啟了此研究方向的里程碑，他們的研究成果發(fā)表在PRL期刊上："Dynamics and Statics of DNA-Programmable Nanoparticle Self-Assembly and Crystallization", C. Knorowski, S. Burleigh and A. Travesset, Phys. Rev. Lett. 106, 215501 (2011) |
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- DPD這種耗散粒子動力學應用于蛋白質(zhì)自組裝研究
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A. Travesset教授的研究團隊主要對基于DNA直接連接的兩種不同類型的納米粒子自組裝進行了模擬，并且只是單一的從較小的模擬體系(N=54)以及唯一的晶格(CsCl)出發(fā)，從均方位移、配分函數(shù)、靜態(tài)結(jié)構(gòu)因子等一系列進行了分析，獲得了跟實驗近似的結(jié)果。2012年，在A. Travesset教授和C. A. Mirkin教授的幫助下，西北大學Monica Olvera de la Cruz教授的研究團隊對Travesset團隊的DNA粗�；Ｐ瓦M行了升級，模型變得更為復雜，但是精準度也相應提升，模擬體系不僅擴大到了256，同時晶格也擴大到Bcc、CsCl、AlB2、Cr3Si和Cs6C60，更為重要的是他們提出了三個關(guān)鍵的控制參數(shù)，并且繪制了相對較為準確的相圖，研究成果發(fā)表在Nano Lett期刊上：Li, T. I. N. G.; Sknepnek, R.; Macfarlane, R. J.; Mirkin, C. A.; Olvera de la Cruz, M. Nano Lett. 2012 , 12 , 2509 −2514；隨后不久，就在同一年，Travesset教授所帶領(lǐng)的研究團隊又對晶格的形成過程進行了精準分析，研究成果發(fā)表在Soft Matter期刊上：Knorowski, C.; Travesset, A. Soft Matter2012 , 8, 12053 −12059;2013年，Monica Olvera de la Cruz教授的研究團隊將最新的研究成果發(fā)表在美國化學會志JACS期刊上：Ting I. N. Li, Rastko Sknepnek, Monica Olvera de la Cruz, JACS 135, 23 (2013)。 |
3樓2013-09-06 17:58:40
2樓2013-09-06 17:38:17
4樓2013-09-06 18:01:28
huterx
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5樓2013-11-22 14:21:06
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6樓2013-11-22 20:20:07
sciencejoy
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7樓2013-11-23 09:49:02
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【答案】應助回帖
★ ★ ★
03010328: 金幣+3, ★有幫助, 謝謝！ 2013-11-25 09:15:08
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還有專門的DNA粗粒化模型程序包 OxDNA， https://dna.physics.ox.ac.uk/index.php/Main_Page |
8樓2013-11-23 10:02:57
9樓2013-11-23 16:53:11
10樓2013-11-23 16:56:17
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