qPCR檢測限為什么不是拷貝數(shù)/反應,而是拷貝數(shù)/mL
目前看到的關于新冠等核酸檢測試劑盒標明的檢測限都是“拷貝數(shù)/mL”,這是怎么測出來的,看了很多文章都說是利用已知濃度的病毒顆;蛸|粒十倍稀釋后看最低能檢測到的拷貝數(shù),并沒有寫明詳細做法。不理解的是,為什么檢測限不以“拷貝數(shù)/反應”來表示,比如1000拷貝/mL的樣品1mL,模板加10μL和1μL肯定是不一樣的,所以這個1000拷貝/mL表示一個反應能檢測到多少呢。如果我們自己設計qPCR反應,檢測限應該達到多少個拷貝/反應才是合適的呢,自己做實驗的時候500個拷貝/反應的ct值就已經36了,是哪里的問題呢
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京公網安備 11010802022153號
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cp/ml是以初始樣本計算的,做得好的,可以做到100cp/ml。
然后取200μl樣本,也就是取到了20個cp,經過核酸提取,回收率一般30~70%,還剩6~14 cp。
洗脫體積50,算上蒸發(fā),剩余30μl 核酸,如果上樣20μl,就是4~9 cp。
那么對應PCR部分不計算提取的檢出限就是4~9 cp/PCR
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老師您好,謝謝您的回答,很好奇qPCR真能做到10 copy/反應啊,我平時做實驗挺粗放,沒有做過這么細。我現(xiàn)在做到500copy/反應的Ct值就已經34、35了,請問這個原因是什么呢,是因為引物設計的不夠好嗎。我的擴增效率用sybrgreen染料法測,計算下來是90%,應該也還行啊。期待您的回復
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