qPCR檢測限為什么不是拷貝數(shù)/反應,而是拷貝數(shù)/mL
目前看到的關于新冠等核酸檢測試劑盒標明的檢測限都是“拷貝數(shù)/mL”,這是怎么測出來的,看了很多文章都說是利用已知濃度的病毒顆;蛸|粒十倍稀釋后看最低能檢測到的拷貝數(shù),并沒有寫明詳細做法。不理解的是,為什么檢測限不以“拷貝數(shù)/反應”來表示,比如1000拷貝/mL的樣品1mL,模板加10μL和1μL肯定是不一樣的,所以這個1000拷貝/mL表示一個反應能檢測到多少呢。如果我們自己設計qPCR反應,檢測限應該達到多少個拷貝/反應才是合適的呢,自己做實驗的時候500個拷貝/反應的ct值就已經36了,是哪里的問題呢
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另外,如果這1ml(100cp/ml)的樣本全部提取,然后用50ul洗脫,假設蒸發(fā)后剩30,上樣20ul的話,這樣計算下來每個反應是20-50cp/PCR,那么是不是也可以宣稱這個試劑檢測下限是100cp/ml 呢,這豈不是有點亂套
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我自己做Taqman方法的,基本都在3~4 cp/PCR,100~1000cp/ml的水平,取決于提取體系、擴增體系的大小。
不亂套,以cp/ml計算,只管你樣本初始濃度,評估的是整套提取+擴增的性能,檢出限只要你保證95%以上檢出率就行。我之前做HBV檢測,600多上樣量,做到2 IU/ml(<12cp/ml,3cp/PCR)就這么做的。
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