肺克基因敲除問題
本人采用red重組敲除,目的片段750bp左右,先電轉(zhuǎn)入含四環(huán)素抗性的pKD46質(zhì)粒,然后用阿拉伯糖誘導(dǎo)重組酶表達(dá)后制作成感受態(tài),電擊轉(zhuǎn)化入重組片段(含上下游同源臂各250bp,卡那霉素抗性基因作為插入片段,總長2000bp),但是第二天平板上都沒有菌落生長
考慮問題:1.重組片段是不是太長,與目的基因長度相差太大導(dǎo)致重組失敗
2.電轉(zhuǎn)效率低,當(dāng)時(shí)電轉(zhuǎn)質(zhì)粒時(shí)只獲得一個(gè)克隆,可能是感受態(tài)制作不行?肺克莢膜很厚,離心的時(shí)候很難離到底,是否有解決方法?能否用固體培養(yǎng)基做阿拉伯糖的誘導(dǎo)?
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京公網(wǎng)安備 11010802022153號(hào)
我敲除的是大腸桿菌,上下同源臂200多bp,篩選標(biāo)記也是卡納,整個(gè)重組片段4000bp左右,轉(zhuǎn)化完后長了三十多個(gè)菌落,片段都敲上去了,但是發(fā)現(xiàn)好像完成的是單交換,野生型和重組片段都能檢測出來,也很是頭疼,估計(jì)你這個(gè)首先要解決的是電轉(zhuǎn)效率的問題
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