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[交流]
有沒有人做過聚合物和蛋白質(zhì)的分子對接 已有5人參與
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![]() 我現(xiàn)在正在做聚合物與受體蛋白的相互作用研究。真是一個負復(fù)雜的過程,聚合物太大整體是不能進入結(jié)合位點的,只能考慮聚合物的某個片段結(jié)合到蛋白的活性位點部位,這是我研究的思路:因為聚合物鏈太長,考慮到蛋白質(zhì)活性位點的空間幾何結(jié)構(gòu),本人將聚合物切斷為幾個不同的片段(每個片段是不同的小分子),分別將它們對接到受體蛋白的結(jié)合位點,然后比較每個片段的得分(親和力大。,得分大的則認為這個片段會優(yōu)先結(jié)合到受體蛋白的口袋里面,聚合物的其他片段則沒有進入到口袋里面。不知道這樣設(shè)計可不可行,請大家?guī)蛶兔Α?br /> 另外,是否有研究聚合物與受體蛋白相互作用的對接軟件? |
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