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6946147木蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
利用GOLD分子對(duì)接，怎么設(shè)置參數(shù)更好的讓它考慮金屬配位作用 已有2人參與
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請(qǐng)教一個(gè)問(wèn)題，在用GOLD對(duì)接時(shí)，直接按照默認(rèn)參數(shù)對(duì)配體分子進(jìn)行對(duì)接時(shí)效果較好，但是對(duì)接我的分子效果相當(dāng)差，好像沒(méi)有考慮金屬配位作用，我需要進(jìn)行什么樣的設(shè)置才行呢？ 我的蛋白是含有血紅素的細(xì)胞色素P450酶，配體分子中含有咪唑環(huán)，應(yīng)該能與鐵形成配位鍵，但是在對(duì)接過(guò)程中不能考慮這個(gè)配位鍵。希望精通GOLD的同志能夠給予幫助，非常感謝�。�！ |
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2樓2016-12-13 09:53:09
zhanglu33
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3樓2016-12-17 15:14:24
6946147
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4樓2016-12-18 21:53:16
zhanglu33
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5樓2016-12-19 08:46:59
6樓2018-07-05 21:33:15
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