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6946147木蟲 (小有名氣)
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[求助]
利用GOLD分子對(duì)接,怎么設(shè)置參數(shù)更好的讓它考慮金屬配位作用 已有2人參與
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請(qǐng)教一個(gè)問題,在用GOLD對(duì)接時(shí),直接按照默認(rèn)參數(shù)對(duì)配體分子進(jìn)行對(duì)接時(shí)效果較好,但是對(duì)接我的分子效果相當(dāng)差,好像沒有考慮金屬配位作用,我需要進(jìn)行什么樣的設(shè)置才行呢? 我的蛋白是含有血紅素的細(xì)胞色素P450酶,配體分子中含有咪唑環(huán),應(yīng)該能與鐵形成配位鍵,但是在對(duì)接過程中不能考慮這個(gè)配位鍵。希望精通GOLD的同志能夠給予幫助,非常感謝。! |

銅蟲 (小有名氣)
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