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[求助]
新手求教，g_bond 和 g_angle不會(huì)用，快死掉了，求大神救救 已有1人參與
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本人在學(xué)習(xí)MD的初期階段，并不太了解各大函數(shù)的具體使用方法 最近對(duì)一個(gè)10bp的DNA分子進(jìn)行了一個(gè)柔性模擬，得出了相應(yīng)的xtc，trr等文件，我現(xiàn)在希望將每一個(gè)構(gòu)象中某三個(gè)原子的角度以及某兩個(gè)原子鍵長隨構(gòu)象的變化函數(shù)分析出來（也就是隨時(shí)間的變化），可惜不會(huì)使用g_bond 和 g_angle 這兩個(gè)函數(shù)的說，求大神幫下忙怎么搞？  |
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jerkwin
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- 專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)
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4樓2016-03-20 00:01:52
jerkwin
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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看看程序文檔和手冊(cè)吧, 很簡單的 http://jerkwin.github.io/9999/12 ... %E6%96%87%E6%A1%A3/ http://jerkwin.github.io/GMX/GMXman-8/#section-9 |
2樓2016-03-19 00:20:24
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我有手冊(cè)，我是一個(gè)核酸分子跑完md后，生成了log,xtc,trr,edr 等文件，我想對(duì)這個(gè)分子進(jìn)行鍵長鍵角分析，就是畫出某一個(gè)鍵長或某一個(gè)鍵角同時(shí)間的圖像，但是那兩個(gè)函數(shù)需要ndx文件索引，怎么把跑完后存在于xtc中或者trr文件中的信息提取出來以適用于鍵長或鍵角分析？大神求指點(diǎn)，別嫌金幣少，小弟真心只有這么多，跪拜大神 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
3樓2016-03-19 15:08:23
商家已經(jīng)主動(dòng)聲明此回帖可能含有宣傳內(nèi)容| 建議參加我們4月在廣州舉辦的GROMACS培訓(xùn)班系統(tǒng)學(xué)習(xí)一下：http://www.gaoyang168.com/bbs/viewthread.php?tid=10053486 |
5樓2016-03-22 20:44:13
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