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[求助]
新手求教，g_bond 和 g_angle不會用，快死掉了，求大神救救 已有1人參與
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本人在學(xué)習(xí)MD的初期階段，并不太了解各大函數(shù)的具體使用方法 最近對一個10bp的DNA分子進(jìn)行了一個柔性模擬，得出了相應(yīng)的xtc，trr等文件，我現(xiàn)在希望將每一個構(gòu)象中某三個原子的角度以及某兩個原子鍵長隨構(gòu)象的變化函數(shù)分析出來（也就是隨時間的變化），可惜不會使用g_bond 和 g_angle 這兩個函數(shù)的說，求大神幫下忙怎么搞？  |
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5樓2016-03-22 20:44:13
jerkwin
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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看看程序文檔和手冊吧, 很簡單的 http://jerkwin.github.io/9999/12 ... %E6%96%87%E6%A1%A3/ http://jerkwin.github.io/GMX/GMXman-8/#section-9 |
2樓2016-03-19 00:20:24
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我有手冊，我是一個核酸分子跑完md后，生成了log,xtc,trr,edr 等文件，我想對這個分子進(jìn)行鍵長鍵角分析，就是畫出某一個鍵長或某一個鍵角同時間的圖像，但是那兩個函數(shù)需要ndx文件索引，怎么把跑完后存在于xtc中或者trr文件中的信息提取出來以適用于鍵長或鍵角分析？大神求指點(diǎn)，別嫌金幣少，小弟真心只有這么多，跪拜大神 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
3樓2016-03-19 15:08:23
jerkwin
專家顧問 (正式寫手)
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4樓2016-03-20 00:01:52
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