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[求助]
gromacs軟件如何計(jì)算鹽橋數(shù)目 已有1人參與
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請(qǐng)問gromacs軟件如何計(jì)算鹽橋的數(shù)目。我用g_sas這個(gè)命令得到3個(gè)xvg文件，但沒有數(shù)目，而命令窗口中出現(xiàn)了一些氨基酸殘基，但是同一個(gè)氨基撒重復(fù)出現(xiàn)幾次，這是算一個(gè)鹽橋？還是有幾次算幾次，詳見下圖 5EI8F3EGD(D5}3WET4B@]1L.png |
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3樓2016-03-22 16:06:59
awaken2013
銅蟲 (小有名氣)
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- 應(yīng)助: 26 (小學(xué)生)
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- 專業(yè): 生物大分子結(jié)構(gòu)與功能
【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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鹽橋是長(zhǎng)程力 而且還沒方向限制 當(dāng)然可能會(huì)一個(gè)原子出現(xiàn)幾次…具體鹽橋數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)還的看你的截?cái)嘣O(shè)置為多少。 我推薦用vmd算 簡(jiǎn)單明了。 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
2樓2016-03-21 23:38:31
4樓2016-04-20 14:54:14
awaken2013
銅蟲 (小有名氣)
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5樓2016-04-20 23:03:56
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