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同源模建評(píng)價(jià)問(wèn)題 已有3人參與
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每次把建好的蛋白PDB格式上傳SAVES網(wǎng)站后 想進(jìn)行PROCHECK，結(jié)果就出現(xiàn)下面的錯(cuò)誤 求解答及解決方法 捕獲.PNG |
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2樓2016-03-28 10:11:58
3樓2016-03-28 16:29:56
wx900901
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4樓2016-04-22 08:40:32
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★
陸鴻遠(yuǎn): 金幣+5, 你說(shuō)的很對(duì) 我后來(lái)找老師幫忙解決了這個(gè)問(wèn)題 用sybyl保存的就可以 2016-05-20 16:34:56
陸鴻遠(yuǎn): 金幣+5, 你說(shuō)的很對(duì) 我后來(lái)找老師幫忙解決了這個(gè)問(wèn)題 用sybyl保存的就可以 2016-05-20 16:34:56
| 應(yīng)該是PDB的問(wèn)題。我在使用PROCHECK的過(guò)程中，發(fā)現(xiàn)某些PDB文件能用，某些PDB文件不行。采用同源模建、分子動(dòng)力學(xué)模擬生成的PDB文件，經(jīng)常不能用。應(yīng)該是PROCHECK對(duì)PDB文件的格式有要求。建議采用多種軟件轉(zhuǎn)換一下。 |
5樓2016-04-22 11:25:02
6樓2016-05-20 16:33:45
許你安然然
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7樓2017-04-04 15:25:03
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8樓2017-04-04 15:51:51
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