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prthefu木蟲 (著名寫手)
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[求助]
從轉(zhuǎn)錄組得到的一段基因方向是·····還有,怎樣判斷得到的基因是否是全長 已有1人參與
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新手,想問一些幼稚的問題, 1. 從轉(zhuǎn)錄組中得到一段基因序列,這段序列的方向是從5'---3'還是3‘---5’? 2. 轉(zhuǎn)錄組測序,得到的那些基因序列是mRNA嗎? 3. 得到的一段基因序列,如何判斷是否為全長? 4. 得到的那一段基因在ORF finder中發(fā)現(xiàn)翻譯氨基酸的是它對(duì)應(yīng)的反向互補(bǔ)序列,那,在擴(kuò)增的時(shí)候是不是要按照反向互補(bǔ)序列來設(shè)計(jì)引物? 5. 反向互補(bǔ)序列翻譯氨基酸的時(shí)候,開頭是起始密碼子,但是在后面找不到終止密碼子,這是不是說明ORF不完整,基因也不是全長? |

木蟲 (小有名氣)
木蟲 (小有名氣)
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1,我覺得,基因的方向是指位于基因組的哪條鏈上,只要知道基因序列比對(duì)一下基因組即可。 2.廣義的轉(zhuǎn)錄組是所有的轉(zhuǎn)錄的RNA,狹義的是mRNA.我理解的真核可以通過polyA得到,原核可能不全是mRNA,為去除rRNA和tRNA后的轉(zhuǎn)錄本。 3.全長為起始密碼子至終止密碼子。 4.兩條鏈都參照。一對(duì)引物分別結(jié)合,擴(kuò)增之間的雙鏈。 5.我認(rèn)為是的。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
木蟲 (著名寫手)
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關(guān)于基因全長,我想問,我有一段基因,是有起始密碼子和終止密碼子,但是在里面找閱讀框翻譯氨基酸的時(shí)候,發(fā)現(xiàn)最后閱讀框最后沒有終止密碼子,也就是閱讀框不完整,那豈不是也說明基因也并不是全長啊 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |

木蟲 (小有名氣)
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