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小木蟲論壇-學術科研互動平臺 » 計算模擬區(qū) » 分子模擬 » 其他 » 鉆石分子動態(tài)建模
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Masterarbeit新蟲 (初入文壇)
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[交流]
鉆石分子動態(tài)建模 已有2人參與
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研究生畢業(yè)論文教授要求用mathematica進行分子動力學建模。 看了兩本書有了大概的思路。 疑惑的是 建模第一步計算立場 計算一個分子的力場書上有基本的計算力場的方法也有一些由經驗來的比如mm amber 等簡化的立場。 但是鉆石是晶體結構 沒有分子式。我應該怎樣處理這個問題，怎樣來計算鉆石的力場。還有公式里所有的參數(shù)在哪里能查到？ 希望前輩們能給提供幫助，初來乍到給沒有金幣可以貢獻。本人學的是機械系統(tǒng)工程教授給了我一個對于我來說全新的題目。希望能和大家多交流。 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
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送紅花一朵 |
明白你的意思了，弄懂了邊界條件的建立，比如我要模擬3.3.3個晶胞就應該建立一個5.5.5的模型。我最近看了很多講tersoff的資料大多都是講了計算的原理和參數(shù)。對于怎樣建立坐標系模擬的具體步驟并不清楚。因為我是要用mathmatica來建模程序都要自己編寫。所以想知道坐標系怎么建立的。比如我要模擬一個5.5.5的金剛石模型大概有1000多個原子，每個原子的坐標我都要自己計算出來嗎？ 發(fā)自小木蟲IOS客戶端 |
10樓2016-04-10 17:47:19
Masterarbeit
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2樓2016-03-31 02:56:27
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新蟲 (初入文壇)
3樓2016-03-31 14:49:38
abinitio
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- 性別: GG
- 專業(yè): 凝聚態(tài)物性I:結構、力學和
- 管轄: 分子模擬
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小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
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能否再多給點信息？ 鉆石就是金剛石，一種結構的C，標準的金剛石結構是固定的，也很好建，如果單純建模也不需要力場，所以： 1、你的要求就只是建出模型就可以了？還是要有后續(xù)計算？ 2、你所說的模型要求多大？比如多少個原子或尺寸？ |
» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）
4樓2016-04-01 08:36:46
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