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[求助]
如何確定H原子坐標(biāo) 已有1人參與
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求助，我現(xiàn)在要對Ca5（AsO4)3OH,Sr（AsO4)3OH在MS中建模，可是文獻中查不到H的原子坐標(biāo)，我要如何確定氫原子的坐標(biāo)呢，這個問題很棘手，各位路過的有經(jīng)驗的前輩指導(dǎo)指導(dǎo)，不勝感激！先謝謝啦！ |
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月只藍
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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H原子太輕，普通的XRD技術(shù)往往捕捉不到H原子的位置，所以文獻中往往沒有給出H原子的坐標(biāo)。 此時，有兩個辦法，一個辦法是自己培養(yǎng)所需晶體的單晶，然后做單晶衍射，解晶體，獲得H原子的坐標(biāo)，這個辦法有實驗數(shù)據(jù)，更能得到同行評審的認可。 另一個辦法就是根據(jù)氫氧鍵的長度，手動添加H原子，然后做幾何優(yōu)化，以幾何優(yōu)化后確定的H原子坐標(biāo)為準(zhǔn)。 |
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悄悄66
2樓2016-04-15 09:30:00
3樓2016-04-15 10:41:19
月只藍
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4樓2016-04-15 10:44:21
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