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[求助]
如何確定H原子坐標(biāo) 已有1人參與
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求助，我現(xiàn)在要對(duì)Ca5（AsO4)3OH,Sr（AsO4)3OH在MS中建模，可是文獻(xiàn)中查不到H的原子坐標(biāo)，我要如何確定氫原子的坐標(biāo)呢，這個(gè)問題很棘手，各位路過的有經(jīng)驗(yàn)的前輩指導(dǎo)指導(dǎo)，不勝感激！先謝謝啦！ |
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月只藍(lán)
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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H原子太輕，普通的XRD技術(shù)往往捕捉不到H原子的位置，所以文獻(xiàn)中往往沒有給出H原子的坐標(biāo)。 此時(shí)，有兩個(gè)辦法，一個(gè)辦法是自己培養(yǎng)所需晶體的單晶，然后做單晶衍射，解晶體，獲得H原子的坐標(biāo)，這個(gè)辦法有實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)，更能得到同行評(píng)審的認(rèn)可。 另一個(gè)辦法就是根據(jù)氫氧鍵的長度，手動(dòng)添加H原子，然后做幾何優(yōu)化，以幾何優(yōu)化后確定的H原子坐標(biāo)為準(zhǔn)。 |
悄悄66
2樓2016-04-15 09:30:00
3樓2016-04-15 10:41:19
月只藍(lán)
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4樓2016-04-15 10:44:21
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