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Dmol3 高手請(qǐng)進(jìn) 已有1人參與
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1,在Dmol3里面怎樣固定一部分原子進(jìn)行幾何優(yōu)化，是固定笛卡爾坐標(biāo)還是固定分?jǐn)?shù)坐標(biāo)？ 我選擇固定分?jǐn)?shù)坐標(biāo)，但是沒(méi)有用，原子還是會(huì)移動(dòng) 2,Materials Studio 的版本不同，是否會(huì)對(duì)計(jì)算結(jié)果產(chǎn)生明顯的影響，尤其是Dmol3這個(gè)模塊 感激不盡 |
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 計(jì)算化學(xué) | MS計(jì)算模擬 |
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1、選中要固定的原子——Modify——Constraints。3、Task選擇Energy，有時(shí)候會(huì)有不收斂的情況，調(diào)節(jié)一下其他參數(shù)。第二個(gè)問(wèn)題不是問(wèn)題，不需考慮。 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶(hù)端 |
5樓2016-05-24 08:53:43
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9樓2016-05-25 10:40:03
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2樓2016-05-22 22:21:29
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4樓2016-05-23 05:20:37
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謝謝你的建議  ，1、選擇Constraints之后還要選擇fix Cartesian poistion 或者fix fractional poistion 這兩個(gè)理論上是都可以的，但是我在選擇fix fractional poistion時(shí)發(fā)現(xiàn)沒(méi)有起到固定效果，優(yōu)化之后原子仍然會(huì)移動(dòng) 3、Task選擇Energy 之后計(jì)算可以收斂，但仍然沒(méi)有能量這一項(xiàng)。我用單機(jī)MS7.0計(jì)算單個(gè)原子能量時(shí)候就一些正常，但是使用集群上MS8.0計(jì)算就出現(xiàn)問(wèn)題，所以我想知道是不是跟版本有關(guān)，或者是集群上軟件安裝有問(wèn)題 |
6樓2016-05-25 09:40:26
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8樓2016-05-25 10:04:49
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10樓2016-05-25 10:42:23
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