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Ccfreesia銅蟲 (小有名氣)
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[求助]
菜鳥求助。。。Dmol3研究汞在表面的吸附 已有1人參與
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1.用Dmol3研究汞在表面的吸附，直接畫汞原子粘貼到真空層中么？汞原子是否需要進(jìn)行結(jié)構(gòu)優(yōu)化？在繪制汞原子的晶格時(shí)晶格常數(shù)根據(jù)什么確定呢？ 2.將汞原子粘貼到真空層的什么位置呢，是根據(jù)什么進(jìn)行計(jì)算。。。 實(shí)驗(yàn)室只有我一個(gè)人研究反應(yīng)機(jī)理，全都靠自學(xué)。。。  苦于無人交流。。。許多問題比較低級(jí)希望大神不吝賜教啊。。。 |
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 MS計(jì)算模擬 |
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單原子吸附的話橋位B是表面兩原子中間點(diǎn)，八面體間隙O選擇六個(gè)原子建中心點(diǎn)(creat centroid按鈕)，四面體間隙T吸附四個(gè)原子建中心點(diǎn)，把單原子加在中心點(diǎn)坐標(biāo)處。 絡(luò)合物吸附的話，原子間距離參照簡單分子鍵長（CuCl2表面吸Hg，可參照HgCl2中Hg-Cl鍵長），鍵長可以參照文獻(xiàn)或?qū)嶒?yàn)結(jié)論，也可以自己建模進(jìn)行幾何優(yōu)化，然后測鍵長。一些軟件（如gaussian）構(gòu)建的時(shí)候會(huì)有鍵長范圍，可以參照。 一般情況下，鍵長鍵角都會(huì)在幾何優(yōu)化后發(fā)生改變，使其達(dá)到較為穩(wěn)定的位置，進(jìn)行幾何優(yōu)化以前的模型一般都比較粗略，鍵長鍵角都是大概的范圍，是否穩(wěn)定可以根據(jù)最終焓等性質(zhì)及幾何優(yōu)化后得到的.xtd文件輔助判斷(點(diǎn)play按鈕看鍵長鍵角變化)。 絡(luò)合物吸附時(shí)小分子相對(duì)于大分子的空間位置我現(xiàn)在也不是很懂，在網(wǎng)上查到的說是添加到近似合理的位置。問了老師但沒告訴我。。。 因?yàn)橹唤佑|這個(gè)一年多一點(diǎn)，老師講的也不是很詳細(xì)。許多意見不一定準(zhǔn)確，僅供參考。 |
9樓2016-06-06 13:36:18
Madajay
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2樓2016-06-04 17:06:59
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3樓2016-06-04 17:10:35
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4樓2016-06-04 18:06:17
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