 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 查看: 2778 | 回復: 12 | |||
wangzhou79鐵桿木蟲 (正式寫手)
|
[交流]
轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中pathway category的選取咨詢，謝謝大家
|
||
|
大家好，最近做了轉(zhuǎn)錄組測序，找華大做的，現(xiàn)在在pathway條目選取中遇到了點問題，特來請教各位大牛。 在pathway的聚類分析中，報告里給了顯著性檢測，p-value和q-value，其中p值是顯著性檢測，q值是假發(fā)現(xiàn)率，報告里的說明了指出，以q值小于等于0.05的為顯著性聚類，可是這樣一來，我的樣品中，能夠聚類的條目只有一兩個，如果是只看p值的話，那還好點，不知道是否一定要以q值來選取聚類條目呢，那些q>0.05而p＜0.05的條目是否有參考價值，還需要對這些條目做哪些進一步分析，可以用來作為差異性的pathway來分析和寫到文章里么？謝謝！ 另外，請教一下大牛們，轉(zhuǎn)錄組分析是不是不能只看公司的報告，自己還能做哪些分析，得到一些更好的信息，謝謝大家！ |
回復此樓» 猜你喜歡
不合理蛙科研實驗之小鼠實驗：嚴謹設(shè)計，解析生命機制的重要載體
已經(jīng)有0人回復
-
不合理蛙科研實驗之重金屬檢測：精準篩查，守護健康與環(huán)境的防線
已經(jīng)有0人回復
-
化學工程及工業(yè)化學論文潤色/翻譯怎么收費?
已經(jīng)有285人回復
-
不合理蛙科研實驗之“蛙測重金屬我背鍋三千”
已經(jīng)有0人回復
-
不合理蛙科研實驗之“鼠逃三次我發(fā)三篇SCI”
已經(jīng)有0人回復
-
納米粒度分析
已經(jīng)有3人回復
-
林科院林化所招收材料與化工專業(yè)碩士，坐標南京
已經(jīng)有0人回復
-
留學--博士招生
已經(jīng)有16人回復
-
化學工程，本211，求調(diào)劑，ab區(qū)不限
已經(jīng)有4人回復
-
邵陽學院食品與化學工程學院碩士調(diào)劑
已經(jīng)有0人回復
行板如歌
金蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 99 (初中生)
- 金幣: 1061.9
- 紅花: 2
- 帖子: 271
- 在線: 92.2小時
- 蟲號: 704928
- 注冊: 2009-02-20
- 性別: GG
- 專業(yè): 園藝作物采后生物學
7樓2016-06-18 21:58:45
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
wangzhou79: 金幣+5 2016-06-15 06:06:27
xn8008: 金幣+1, 支持積極回帖，不過希望以后把您的建議寫在帖子里，供大家學習，謝謝 2016-06-15 10:29:49
小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
wangzhou79: 金幣+5 2016-06-15 06:06:27
xn8008: 金幣+1, 支持積極回帖，不過希望以后把您的建議寫在帖子里，供大家學習，謝謝 2016-06-15 10:29:49
|
如果篩選出來的太少，就放寬條件，我也是做轉(zhuǎn)錄的，方便的話，留點信息，我加你 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
4樓2016-06-14 23:30:17
★
wangzhou79: 金幣+1 2016-06-15 06:06:09
wangzhou79: 金幣+1 2016-06-15 06:06:09
 本帖僅樓主可見 |
2樓2016-06-13 09:06:41
★
wangzhou79: 金幣+1 2016-06-15 06:06:16
wangzhou79: 金幣+1 2016-06-15 06:06:16
| 祝福 |
3樓2016-06-13 12:26:00
wangzhou79
鐵桿木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 2 (幼兒園)
- 金幣: 6232.3
- 散金: 2243
- 紅花: 1
- 帖子: 920
- 在線: 307.5小時
- 蟲號: 848766
- 注冊: 2009-09-15
- 性別: GG
- 專業(yè): 微生物生理與生物化學
5樓2016-06-15 06:12:54
| 祝福 |
6樓2016-06-15 12:46:12
ygidtu
新蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 4 (幼兒園)
- 金幣: 1690.7
- 散金: 798
- 紅花: 3
- 帖子: 419
- 在線: 117.7小時
- 蟲號: 2854989
- 注冊: 2013-12-07
- 性別: GG
- 專業(yè): 生物信息學
★ ★ ★ ★
小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
wangzhou79: 金幣+3 2016-06-24 22:31:34
小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
wangzhou79: 金幣+3 2016-06-24 22:31:34
|
一般都不采用p的，不論pq，0.05都是一道坎，可以嘗試放寬別的條件再做一次pathway富集 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
8樓2016-06-18 22:31:18
wangzhou79
鐵桿木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 2 (幼兒園)
- 金幣: 6232.3
- 散金: 2243
- 紅花: 1
- 帖子: 920
- 在線: 307.5小時
- 蟲號: 848766
- 注冊: 2009-09-15
- 性別: GG
- 專業(yè): 微生物生理與生物化學
9樓2016-06-24 22:30:18
wangzhou79
鐵桿木蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 2 (幼兒園)
- 金幣: 6232.3
- 散金: 2243
- 紅花: 1
- 帖子: 920
- 在線: 307.5小時
- 蟲號: 848766
- 注冊: 2009-09-15
- 性別: GG
- 專業(yè): 微生物生理與生物化學
10樓2016-06-24 22:31:14
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 wangzhou79 的主題更新
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 材料專碩調(diào)劑 +8 | 椰椰。 2026-03-29 | 8/400 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 化學308分調(diào)劑 +7 | 你好明天你好 2026-03-30 | 7/350 |
|
|
[考研] 332求調(diào)劑 +6 | Lyy930824@ 2026-03-29 | 6/300 |
|
|
|
[碩博家園] 求調(diào)劑 有機化學考研356分 +9 | Nadiums 2026-03-25 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑，一志愿 南京航空航天大學大學 ，080500材料科學與工程學碩 +6 | @taotao 2026-03-26 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 0856求調(diào)劑 +8 | 楒桉 2026-03-28 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 求調(diào)劑 +10 | 張zz111 2026-03-27 | 11/550 |
|
|
|
[考研] 317分 一志愿南理工材料工程 本科湖工大 求調(diào)劑 +10 | 芋泥小鈴鐺 2026-03-28 | 10/500 |
|
|
|
[考研] 【求調(diào)劑】085601材料工程專碩 | 總分272 | +7 | 腳滑的守法公民 2026-03-27 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 0856求調(diào)劑 +13 | zhn03 2026-03-25 | 14/700 |
|
|
|
[考研] 329求調(diào)劑 +7 | 星野? 2026-03-26 | 7/350 |
|
|
|
[碩博家園] 招收生物學/細胞生物學調(diào)劑 +4 | IceGuo 2026-03-26 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 315求調(diào)劑 +4 | akie... 2026-03-28 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 生物學學碩，一志愿湖南大學，初試成績338 +6 | YYYYYNNNNN 2026-03-26 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 食品工程專碩一志愿中海洋309求調(diào)劑 +4 | 小張zxy張 2026-03-26 | 8/400 |
|
|
|
[考研] 304求調(diào)劑 +6 | 曼殊2266 2026-03-27 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 348求調(diào)劑 +4 | 小懶蟲不懶了 2026-03-27 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 一志愿哈工大，085400，320，求調(diào)劑 +4 | gdlf9999 2026-03-24 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿南航 335分 | 0856材料化工 | GPA 4.07 | 有科研經(jīng)歷 +6 | cccchenso 2026-03-23 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 【2026考研調(diào)劑】制藥工程 284分 求相關(guān)專業(yè)調(diào)劑名額 +4 | 袁奐奐 2026-03-25 | 8/400 |
|