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[求助]
蛋白酶基因片段 質(zhì)粒表達 提取蛋白 已有3人參與
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大家好，想問一下知道某一種酶的在PDB里面的ID（比如 3TS1），怎么找到它的基因序列，然后找公司導到質(zhì)粒里面，最后在大腸桿菌里面表達蛋白、提取蛋白？麻煩說一下大概步驟~ 第一次做生物...謝謝謝謝 |
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4樓2016-07-06 08:11:22
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2樓2016-07-05 17:05:35
【答案】應助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應助指數(shù) +1
lvyueguang: 金幣+5, ★★★很有幫助 2016-07-07 15:36:05
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一般序列信息結(jié)構(gòu)對應的文獻里都能找到。但像你舉的這個例子，文獻比較老。可以先找蛋白序列，再通過blastp找到其在NCBI中的對應信息。方法：在PDB網(wǎng)站主頁，搜索3TS1，在結(jié)果界面，點擊右上display按鈕，選擇顯示fasta格式序列，就可以顯示其蛋白質(zhì)序列。如下：>3TS1:A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE MDLLAELQWRGLVNQTTDEDGLRKLLNEERVTLYCGFDPTADSLHIGHLATILTMRRFQQAGHRPIALVGGATGLIGDPS GKKSERTLNAKETVEAWSARIKEQLGRFLDFEADGNPAKIKNNYDWIGPLDVITFLRDVGKHFSVNYMMAKESVQSRIET GISFTEFSYMMLQAYDFLRLYETEGCRLQIGGSDQWGNITAGLELIRKTKGEARAFGLTIPLVTKADGTKFGKTESGTIW LDKEKTSPYEFYQFWINTDDRDVIRYLKYFTFLSKEEIEALEQELREAPEKRAAQKTLAEEVTKLVHGEEALRQAIRISE ALFSGDIANLTAAEIEQGFKDVPSFVHEGGDVPLVELLVSAGISPSKRQAREDIQNGAIYVNGERLQDVGAILTAEHRLE GRFTVIRRGKKKYYLIRYA 經(jīng)tblastn可知該段蛋白對應的NCBI中登錄號：J01546 |
3樓2016-07-05 18:46:40
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5樓2016-07-06 14:17:54
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