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lvyueguang新蟲 (初入文壇)
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[求助]
蛋白酶基因片段 質(zhì)粒表達(dá) 提取蛋白 已有3人參與
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大家好，想問一下知道某一種酶的在PDB里面的ID（比如 3TS1），怎么找到它的基因序列，然后找公司導(dǎo)到質(zhì)粒里面，最后在大腸桿菌里面表達(dá)蛋白、提取蛋白？麻煩說一下大概步驟~ 第一次做生物...謝謝謝謝 |
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2樓2016-07-05 17:05:35
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
lvyueguang: 金幣+5, ★★★很有幫助 2016-07-07 15:36:05
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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一般序列信息結(jié)構(gòu)對應(yīng)的文獻(xiàn)里都能找到。但像你舉的這個(gè)例子，文獻(xiàn)比較老�？梢韵日业鞍仔蛄�，再通過blastp找到其在NCBI中的對應(yīng)信息。方法：在PDB網(wǎng)站主頁，搜索3TS1，在結(jié)果界面，點(diǎn)擊右上display按鈕，選擇顯示fasta格式序列，就可以顯示其蛋白質(zhì)序列。如下：>3TS1:A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE MDLLAELQWRGLVNQTTDEDGLRKLLNEERVTLYCGFDPTADSLHIGHLATILTMRRFQQAGHRPIALVGGATGLIGDPS GKKSERTLNAKETVEAWSARIKEQLGRFLDFEADGNPAKIKNNYDWIGPLDVITFLRDVGKHFSVNYMMAKESVQSRIET GISFTEFSYMMLQAYDFLRLYETEGCRLQIGGSDQWGNITAGLELIRKTKGEARAFGLTIPLVTKADGTKFGKTESGTIW LDKEKTSPYEFYQFWINTDDRDVIRYLKYFTFLSKEEIEALEQELREAPEKRAAQKTLAEEVTKLVHGEEALRQAIRISE ALFSGDIANLTAAEIEQGFKDVPSFVHEGGDVPLVELLVSAGISPSKRQAREDIQNGAIYVNGERLQDVGAILTAEHRLE GRFTVIRRGKKKYYLIRYA 經(jīng)tblastn可知該段蛋白對應(yīng)的NCBI中登錄號：J01546 |
3樓2016-07-05 18:46:40
star013 
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4樓2016-07-06 08:11:22
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5樓2016-07-06 14:17:54
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7樓2016-07-07 15:36:29
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9樓2016-07-07 15:39:32
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