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lvyueguang新蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
蛋白酶基因片段 質(zhì)粒表達(dá) 提取蛋白 已有3人參與
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大家好,想問(wèn)一下知道某一種酶的在PDB里面的ID(比如 3TS1),怎么找到它的基因序列,然后找公司導(dǎo)到質(zhì)粒里面,最后在大腸桿菌里面表達(dá)蛋白、提取蛋白?麻煩說(shuō)一下大概步驟~ 第一次做生物...謝謝謝謝 |
新蟲(chóng) (初入文壇)
鐵桿木蟲(chóng) (職業(yè)作家)

鐵桿木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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一般序列信息結(jié)構(gòu)對(duì)應(yīng)的文獻(xiàn)里都能找到。但像你舉的這個(gè)例子,文獻(xiàn)比較老?梢韵日业鞍仔蛄,再通過(guò)blastp找到其在NCBI中的對(duì)應(yīng)信息。方法:在PDB網(wǎng)站主頁(yè),搜索3TS1,在結(jié)果界面,點(diǎn)擊右上display按鈕,選擇顯示fasta格式序列,就可以顯示其蛋白質(zhì)序列。如下:>3TS1:A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE MDLLAELQWRGLVNQTTDEDGLRKLLNEERVTLYCGFDPTADSLHIGHLATILTMRRFQQAGHRPIALVGGATGLIGDPS GKKSERTLNAKETVEAWSARIKEQLGRFLDFEADGNPAKIKNNYDWIGPLDVITFLRDVGKHFSVNYMMAKESVQSRIET GISFTEFSYMMLQAYDFLRLYETEGCRLQIGGSDQWGNITAGLELIRKTKGEARAFGLTIPLVTKADGTKFGKTESGTIW LDKEKTSPYEFYQFWINTDDRDVIRYLKYFTFLSKEEIEALEQELREAPEKRAAQKTLAEEVTKLVHGEEALRQAIRISE ALFSGDIANLTAAEIEQGFKDVPSFVHEGGDVPLVELLVSAGISPSKRQAREDIQNGAIYVNGERLQDVGAILTAEHRLE GRFTVIRRGKKKYYLIRYA 經(jīng)tblastn可知該段蛋白對(duì)應(yīng)的NCBI中登錄號(hào):J01546 |
新蟲(chóng) (知名作家)
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