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kuaile5420專家顧問(wèn) (著名寫(xiě)手)
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[求助]
為什么NCBI和UCSC調(diào)出的序列會(huì)不一樣但是卻100%匹配呢 已有2人參與
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| 最近在查找一個(gè)基因的序列，根據(jù)染色體的位置在UCSC和NCBI中分別調(diào)出該序列，但是觀察發(fā)現(xiàn)前面的一些堿基都不是完全匹配的，可是在NCBI將兩序列進(jìn)行Blast，發(fā)現(xiàn)竟然100%匹配，而且NCBI中的序列信息變得和UCSC一樣的，很奇怪是為什么？推測(cè)是基于的Genome測(cè)序版本不一樣導(dǎo)致的？UCSC選擇的是Dec.2013(GRCh38/hg38),NCBI現(xiàn)在是那個(gè)版本呢？萬(wàn)分感謝��！ |
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2樓2016-07-08 11:45:56
stone2239
鐵桿木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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3樓2016-07-08 14:37:53
ygidtu
新蟲(chóng) (正式寫(xiě)手)
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- 專業(yè): 生物信息學(xué)
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版本一般不會(huì)影響到這個(gè)把。一般用的是hg19,hg38,我覺(jué)著你可以看一下外顯子內(nèi)含子的問(wèn)題，有可能是兩者邊緣模糊，或者是什么亞型直接的 發(fā)自小木蟲(chóng)Android客戶端 |
4樓2016-07-09 11:08:50
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