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kuaile5420專家顧問 (著名寫手)
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[求助]
為什么NCBI和UCSC調(diào)出的序列會不一樣但是卻100%匹配呢 已有2人參與
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| 最近在查找一個基因的序列，根據(jù)染色體的位置在UCSC和NCBI中分別調(diào)出該序列，但是觀察發(fā)現(xiàn)前面的一些堿基都不是完全匹配的，可是在NCBI將兩序列進行Blast，發(fā)現(xiàn)竟然100%匹配，而且NCBI中的序列信息變得和UCSC一樣的，很奇怪是為什么？推測是基于的Genome測序版本不一樣導(dǎo)致的？UCSC選擇的是Dec.2013(GRCh38/hg38),NCBI現(xiàn)在是那個版本呢？萬分感謝��！ |
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2樓2016-07-08 11:45:56
3樓2016-07-08 14:37:53
ygidtu
新蟲 (正式寫手)
- 應(yīng)助: 4 (幼兒園)
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- 散金: 798
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- 帖子: 419
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- 蟲號: 2854989
- 注冊: 2013-12-07
- 性別: GG
- 專業(yè): 生物信息學
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版本一般不會影響到這個把。一般用的是hg19,hg38,我覺著你可以看一下外顯子內(nèi)含子的問題，有可能是兩者邊緣模糊，或者是什么亞型直接的 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
4樓2016-07-09 11:08:50
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