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關(guān)于轉(zhuǎn)錄組序列需不需要拿去克隆的問題 已有1人參與
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各位大神： 剛開始接觸分子，很多都不懂，有個問題想請教一下各位，我?guī)熜秩ツ昴梦覀兊膶嶒灢牧纤腿y序，測得了轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫，我在通路和功能注釋里面找到了跟生長和免疫相關(guān)的一些基因序列，設(shè)計了引物，想拿去跑RT-PCR，驗證不同處理對我們的實驗材料的生長基因的表達(dá)有沒有影響，實驗材料定期取樣。因為我們的材料在分子這塊剛剛開始，以前沒人做過相關(guān)的實驗，我找的序列不是從NCBI里面直接查到的序列，是自己的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫里面的，內(nèi)參也是自己庫里的找到的β-actin相關(guān)的序列，引物是https://www.genscript.com/ssl-bin/app/primer這個網(wǎng)頁設(shè)計的，試跑PCR之后，目的基因和內(nèi)參都擴(kuò)出來了，沒有非特異性擴(kuò)增二聚體之類的東西，只有一個峰，pcr產(chǎn)物也只有一條帶，我想問的是，如果用自己庫里的相關(guān)序列發(fā)表論文的話，人家期刊會不會不承認(rèn)，認(rèn)為測出來的序列不準(zhǔn)確，需不需要拿去克隆，一定要克隆出來才能承認(rèn)我們的序列是可用的嗎？ 希望各位大神予以解答。 |
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【答案】應(yīng)助回帖
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西門吹雪170: 金幣+1, 鼓勵回帖交流 2016-07-12 07:31:33
xn8008: 金幣+1, 應(yīng)助指數(shù)+1, 歡迎發(fā)帖交流 2016-07-12 09:43:39
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| 既然擴(kuò)出來了，且只有一個峰，直接把PCR產(chǎn)物送測序，然后把測序結(jié)果和轉(zhuǎn)錄組結(jié)果比對一下，確定是你要擴(kuò)的序列，很多期刊要求文章中的序列要有登錄號，你可以把你測序驗證后序列單另提交到NCBI的genbank數(shù)據(jù)庫。 |
» 本帖已獲得的紅花（最新10朵）
2樓2016-07-11 19:59:59
3樓2016-07-13 10:04:35
4樓2016-07-13 14:14:20
yuguiyan
至尊木蟲 (文壇精英)
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