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zhangxf2014新蟲 (小有名氣)
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[求助]
定量PCR 已有3人參與
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| 剛開始做定量PCR,用的SYBR染料法,陰性對(duì)照(只加水)總是有擴(kuò)增,Ct值都在35以下。之后換實(shí)驗(yàn)室、換水、換槍,引物重新合成,試劑也是新開的,但是還是存在陰性擴(kuò)增,電泳檢測(cè),NTC條帶和目的基因的一致,F(xiàn)在用UDG試劑做的,問(wèn)題仍然無(wú)法解決,實(shí)在想不通是什么原因?實(shí)驗(yàn)室有個(gè)老師半個(gè)月就把定量做完了,我這都做了2個(gè)月了。求大神賜教。。! |
新蟲 (小有名氣)
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新蟲 (小有名氣)
新蟲 (初入文壇)
木蟲 (正式寫手)
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污染可能存在以下幾個(gè)方面: 1、以前有人做過(guò)你所擴(kuò)增的片段的擴(kuò)增,導(dǎo)致整個(gè)環(huán)境中到處都是。 2、擴(kuò)增的時(shí)候自己沒(méi)有注意好,導(dǎo)致環(huán)境、試劑、槍頭等污染了目的擴(kuò)增片段。 即使用了UDG,因?yàn)槿绻皇亲铋_始就用這個(gè)的話,是無(wú)法防止污染的。因?yàn)閁DG的原理導(dǎo)致它不能解決使用前所發(fā)生的污染,只能解決它自身體系的污染。 實(shí)驗(yàn)室污染解決的辦法:如果是整個(gè)大環(huán)境污染,每天晚上用5%的84消毒液霧化消毒,超凈臺(tái)、離心機(jī)轉(zhuǎn)子等關(guān)鍵儀器用10%84消毒液全部擦拭,第二天早晨再用清水擦洗環(huán)境,大約經(jīng)過(guò)一個(gè)星期后,應(yīng)該可以讓ct值降到37、38甚至沒(méi)有,提dna和提rna都別開超凈臺(tái)風(fēng)機(jī)(不開風(fēng)機(jī)提取核酸完全沒(méi)問(wèn)題的,而且如果污染,超凈臺(tái)上面的那層濾網(wǎng)上面估計(jì)富集了很多目的片段)、槍頭用帶濾芯的槍頭,EP管直接用商家處理好的。等等。 解決污染是一個(gè)非常痛苦的過(guò)程,因?yàn)檎麄(gè)環(huán)境中都是84消毒液的味道是很難聞的一件事。我的實(shí)驗(yàn)室每天都在堅(jiān)持,但是還是經(jīng)常陰性對(duì)照的ct值在35之后起來(lái)。 其實(shí)最好的方法是找一個(gè)沒(méi)有做過(guò)你的基因相關(guān)的實(shí)驗(yàn)室,用全新的試劑來(lái)做這個(gè)實(shí)驗(yàn),并且剛開始就使用UDG防污染體系。 |
新蟲 (小有名氣)
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非常感謝!我覺(jué)得不是環(huán)境污染,因?yàn)橐苍谀莻(gè)老師的實(shí)驗(yàn)室做過(guò),他NTC沒(méi)有,我的都擴(kuò)出來(lái)了。 發(fā)自小木蟲Android客戶端 |
木蟲 (著名寫手)

新蟲 (小有名氣)
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