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anyeout新蟲 (初入文壇)
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真菌PKS NPRS基因篩選 已有2人參與
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| 本人是做微生物天然產物的新手,發(fā)現(xiàn)文獻中有很多關于放線菌中PKS、NPRS基因的篩選,但是有關真菌PKS、NPRS的篩選很少,想請問各位蟲友,可否用PCR方法對真菌中這兩種基因進行篩選?引物是什么?放線菌和真菌中編碼這兩種酶的基因一樣嗎? |
銀蟲 (初入文壇)
新蟲 (初入文壇)
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上網(wǎng)給你找的,基因篩選的方法: 1、從基因文庫中獲得目的基因. 方法: 第一步,通過PCR方法將目的基因已知的部分核苷酸序列擴增出來,進行放射性同位素標記(也可以用別的標記方法進行,如生物素、熒光素等),即用標記了放射性同位素的目的DNA片段作為探針,與擴增出來的DNA雜交. 第二步,將基因文庫中的所有菌落轉移至硝酸纖維膜上(也可以用其他類型的膜),然后,通過處理溶解消化掉細菌中的蛋白質,并使DNA固定在膜上. 第三步,按Southern雜交的方法進行雜交. 第四步,在X光底片上出現(xiàn)黑斑的菌落,這表明這個菌落中含有所需要的目的基因(若選用別的標記方法,有陽性信號的菌落則含有所需要的目的基因). 第五步,從該菌落中再提取目的基因. 2、PCR 篩選法方法: 第一步:將反應體系(包括雙鏈模板、引物、耐高溫的DNA聚合酶、四種脫氧核糖核苷酸以及酶促反應所需的離子等)加熱至90~95 ℃,使雙鏈DNA模板兩條鏈之間的氫鍵打開,變成單鏈DNA,作為互補鏈聚合反應的模板. 第二步:將反應體系降溫至55~60 ℃,使兩種引物分別與模板DNA鏈3′端的互補序列互補配對,這個過程稱為復性. 第三步:將反應體系升溫至70~75 ℃,在耐高溫的DNA聚合酶催化作用下,將與模板互補的單個核苷酸加到引物所提供的3-OH上,使DNA鏈延伸,產生一條與模板鏈互補的DNA鏈. 上述三步反應完成后,一個DNA分子就變成了兩個DNA分子,隨著重復次數(shù)的增多,DNA分子就以2n的形式增加.PCR的反應過程都是在PCR擴增儀中完成的. 3、核酸雜交法、 DNA和DNA分子之間的雜交.目的基因是否整合到受體生物的染色體DNA中,這在真核生物中是目的基因可否穩(wěn)定存在和遺傳的關鍵.如何證明這一點,就需要通過Southern雜交技術.基本做法是: 第一步,將受體生物DNA提取出來,經(jīng)過適當?shù)拿盖泻?走瓊脂糖凝膠電泳,將不同大小的片段分開; 第二步,將凝膠上的DNA片段轉移到硝酸纖維素膜上; 第三步,用標記了放射性同位素(或生物素)的目的DNA片段作為探針與硝酸纖維素膜上的DNA進行雜交; 第四步,將X光底片壓在硝酸纖維素膜上,在暗處使底片感光; 第五步,將X光底片沖洗,如果在底片上出現(xiàn)黑色條帶,則表明受體植物染色體DNA上有目的基因. 4、免疫篩選法 Western雜交──蛋白質分子(抗原—抗體)之間的雜交.它是檢測目的基因是否表達出蛋白質的一種方法.具體做法是: 第一步,將目的基因在大腸桿菌中表達出蛋白質; 第二步,將表達出的蛋白質注射動物進行免疫,產生相應的抗體,并提取出抗體(一抗); 第三步,從轉基因生物中提取蛋白質,走凝膠電泳; 第四步,將凝膠中的蛋白轉移到硝酸纖維素膜上; 第五步,將抗體(一抗)與硝酸纖維素膜上的蛋白雜交,這時抗體(一抗)與目的基因表達的蛋白(抗原)會特異結合.由于這種抗原—抗體的結合顯示不出條帶,所以加入一種稱為二抗的抗體,它可以與一抗結合,二抗抗體上帶有特殊的標記.如果目的基因表達出了蛋白質,則結果為陽性. |
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